Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TTC41PQ6P2S7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TTC41PQ6P2S7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TTC41PQ6P2S7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TTC41PQ6P2S7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
TTC41PQ6P2S7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TTC41PQ6P2S7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TTC41PQ6P2S7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TTC41PQ6P2S7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TTC41PQ6P2S7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TTC41PQ6P2S7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TTC41PQ6P2S7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TTC41PQ6P2S7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TTC41PQ6P2S7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TTC41PQ6P2S7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TTC41PQ6P2S7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
TTC41PQ6P2S7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TTC41PQ6P2S7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TTC41PQ6P2S7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TTC41PQ6P2S7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TTC41PQ6P2S7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TTC41PQ6P2S7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TTC41PQ6P2S7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TTC41PQ6P2S7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TTC41PQ6P2S7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TTC41PQ6P2S7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TTC41PQ6P2S7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TTC41PQ6P2S7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TTC41PQ6P2S7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TTC41PQ6P2S7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TTC41PQ6P2S7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TTC41PQ6P2S7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TTC41PQ6P2S7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TTC41PQ6P2S7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TTC41PQ6P2S7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TTC41PQ6P2S7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TTC41PQ6P2S7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TTC41PQ6P2S7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TTC41PQ6P2S7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TTC41PQ6P2S7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TTC41PQ6P2S7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TTC41PQ6P2S7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TTC41PQ6P2S7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TTC41PQ6P2S7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TTC41PQ6P2S7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TTC41PQ6P2S7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TTC41PQ6P2S7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TTC41PQ6P2S7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TTC41PQ6P2S7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TTC41PQ6P2S7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TTC41PQ6P2S7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TTC41PQ6P2S7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TTC41PQ6P2S7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TTC41PQ6P2S7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TTC41PQ6P2S7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TTC41PQ6P2S7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TTC41PQ6P2S7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TTC41PQ6P2S7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TTC41PQ6P2S7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TTC41PQ6P2S7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
TTC41PQ6P2S7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TTC41PQ6P2S7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TTC41PQ6P2S7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TTC41PQ6P2S7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TTC41PQ6P2S7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TTC41PQ6P2S7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
TTC41PQ6P2S7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
TTC41PQ6P2S7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TTC41PQ6P2S7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TTC41PQ6P2S7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
TTC41PQ6P2S7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TTC41PQ6P2S7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TTC41PQ6P2S7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TTC41PQ6P2S7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TTC41PQ6P2S7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TTC41PQ6P2S7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TTC41PQ6P2S7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TTC41PQ6P2S7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TTC41PQ6P2S7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TTC41PQ6P2S7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TTC41PQ6P2S7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TTC41PQ6P2S7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TTC41PQ6P2S7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TTC41PQ6P2S7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TTC41PQ6P2S7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TTC41PQ6P2S7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TTC41PQ6P2S7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TTC41PQ6P2S7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TTC41PQ6P2S7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TTC41PQ6P2S7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TTC41PQ6P2S7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TTC41PQ6P2S7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TTC41PQ6P2S7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TTC41PQ6P2S7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TTC41PQ6P2S7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TTC41PQ6P2S7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TTC41PQ6P2S7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TTC41PQ6P2S7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TTC41PQ6P2S7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
TTC41PQ6P2S7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms