Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUM9

RETSAT, All-trans-retinol 13,14-reductase, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETSATQ6NUM9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RETSATQ6NUM9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RETSATQ6NUM9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RETSATQ6NUM9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RETSATQ6NUM9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RETSATQ6NUM9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RETSATQ6NUM9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RETSATQ6NUM9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RETSATQ6NUM9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RETSATQ6NUM9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RETSATQ6NUM9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RETSATQ6NUM9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RETSATQ6NUM9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RETSATQ6NUM9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RETSATQ6NUM9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RETSATQ6NUM9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RETSATQ6NUM9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RETSATQ6NUM9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RETSATQ6NUM9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RETSATQ6NUM9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RETSATQ6NUM9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RETSATQ6NUM9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RETSATQ6NUM9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RETSATQ6NUM9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RETSATQ6NUM9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RETSATQ6NUM9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RETSATQ6NUM9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RETSATQ6NUM9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RETSATQ6NUM9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RETSATQ6NUM9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RETSATQ6NUM9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RETSATQ6NUM9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RETSATQ6NUM9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RETSATQ6NUM9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RETSATQ6NUM9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RETSATQ6NUM9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RETSATQ6NUM9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RETSATQ6NUM9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RETSATQ6NUM9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RETSATQ6NUM9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RETSATQ6NUM9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RETSATQ6NUM9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RETSATQ6NUM9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RETSATQ6NUM9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RETSATQ6NUM9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RETSATQ6NUM9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RETSATQ6NUM9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RETSATQ6NUM9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RETSATQ6NUM9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RETSATQ6NUM9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RETSATQ6NUM9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RETSATQ6NUM9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RETSATQ6NUM9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RETSATQ6NUM9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RETSATQ6NUM9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RETSATQ6NUM9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RETSATQ6NUM9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RETSATQ6NUM9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RETSATQ6NUM9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RETSATQ6NUM9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RETSATQ6NUM9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RETSATQ6NUM9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RETSATQ6NUM9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RETSATQ6NUM9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RETSATQ6NUM9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RETSATQ6NUM9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RETSATQ6NUM9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RETSATQ6NUM9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RETSATQ6NUM9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RETSATQ6NUM9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RETSATQ6NUM9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RETSATQ6NUM9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RETSATQ6NUM9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RETSATQ6NUM9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RETSATQ6NUM9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RETSATQ6NUM9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RETSATQ6NUM9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RETSATQ6NUM9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RETSATQ6NUM9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RETSATQ6NUM9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RETSATQ6NUM9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RETSATQ6NUM9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RETSATQ6NUM9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RETSATQ6NUM9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RETSATQ6NUM9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RETSATQ6NUM9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RETSATQ6NUM9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RETSATQ6NUM9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RETSATQ6NUM9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RETSATQ6NUM9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RETSATQ6NUM9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RETSATQ6NUM9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RETSATQ6NUM9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RETSATQ6NUM9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RETSATQ6NUM9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RETSATQ6NUM9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RETSATQ6NUM9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RETSATQ6NUM9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RETSATQ6NUM9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RETSATQ6NUM9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161 ms