Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDE2Q6IQ49 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SDE2Q6IQ49 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDE2Q6IQ49 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDE2Q6IQ49 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDE2Q6IQ49 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SDE2Q6IQ49 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SDE2Q6IQ49 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDE2Q6IQ49 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDE2Q6IQ49 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDE2Q6IQ49 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDE2Q6IQ49 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SDE2Q6IQ49 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SDE2Q6IQ49 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SDE2Q6IQ49 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SDE2Q6IQ49 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SDE2Q6IQ49 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SDE2Q6IQ49 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SDE2Q6IQ49 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDE2Q6IQ49 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDE2Q6IQ49 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDE2Q6IQ49 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDE2Q6IQ49 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SDE2Q6IQ49 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDE2Q6IQ49 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDE2Q6IQ49 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SDE2Q6IQ49 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDE2Q6IQ49 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDE2Q6IQ49 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDE2Q6IQ49 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDE2Q6IQ49 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SDE2Q6IQ49 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SDE2Q6IQ49 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SDE2Q6IQ49 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SDE2Q6IQ49 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SDE2Q6IQ49 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SDE2Q6IQ49 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDE2Q6IQ49 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDE2Q6IQ49 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDE2Q6IQ49 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDE2Q6IQ49 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDE2Q6IQ49 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SDE2Q6IQ49 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDE2Q6IQ49 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDE2Q6IQ49 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDE2Q6IQ49 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDE2Q6IQ49 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SDE2Q6IQ49 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDE2Q6IQ49 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDE2Q6IQ49 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDE2Q6IQ49 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDE2Q6IQ49 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDE2Q6IQ49 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDE2Q6IQ49 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDE2Q6IQ49 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDE2Q6IQ49 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDE2Q6IQ49 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SDE2Q6IQ49 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDE2Q6IQ49 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDE2Q6IQ49 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SDE2Q6IQ49 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDE2Q6IQ49 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SDE2Q6IQ49 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDE2Q6IQ49 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDE2Q6IQ49 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDE2Q6IQ49 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDE2Q6IQ49 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDE2Q6IQ49 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDE2Q6IQ49 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDE2Q6IQ49 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDE2Q6IQ49 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDE2Q6IQ49 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDE2Q6IQ49 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDE2Q6IQ49 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDE2Q6IQ49 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDE2Q6IQ49 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDE2Q6IQ49 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDE2Q6IQ49 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDE2Q6IQ49 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDE2Q6IQ49 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDE2Q6IQ49 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDE2Q6IQ49 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDE2Q6IQ49 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDE2Q6IQ49 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDE2Q6IQ49 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDE2Q6IQ49 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDE2Q6IQ49 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SDE2Q6IQ49 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDE2Q6IQ49 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDE2Q6IQ49 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDE2Q6IQ49 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDE2Q6IQ49 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDE2Q6IQ49 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDE2Q6IQ49 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDE2Q6IQ49 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDE2Q6IQ49 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDE2Q6IQ49 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDE2Q6IQ49 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDE2Q6IQ49 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDE2Q6IQ49 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms