Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPPQ6IPU0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPPQ6IPU0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPPQ6IPU0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPPQ6IPU0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPPQ6IPU0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPPQ6IPU0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPPQ6IPU0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPPQ6IPU0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPPQ6IPU0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPPQ6IPU0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPPQ6IPU0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPPQ6IPU0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPPQ6IPU0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPPQ6IPU0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPPQ6IPU0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPPQ6IPU0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPPQ6IPU0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPPQ6IPU0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CENPPQ6IPU0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CENPPQ6IPU0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CENPPQ6IPU0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CENPPQ6IPU0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CENPPQ6IPU0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CENPPQ6IPU0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CENPPQ6IPU0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CENPPQ6IPU0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CENPPQ6IPU0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CENPPQ6IPU0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CENPPQ6IPU0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CENPPQ6IPU0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CENPPQ6IPU0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CENPPQ6IPU0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CENPPQ6IPU0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CENPPQ6IPU0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CENPPQ6IPU0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CENPPQ6IPU0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CENPPQ6IPU0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CENPPQ6IPU0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CENPPQ6IPU0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CENPPQ6IPU0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CENPPQ6IPU0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CENPPQ6IPU0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CENPPQ6IPU0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CENPPQ6IPU0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CENPPQ6IPU0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CENPPQ6IPU0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CENPPQ6IPU0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CENPPQ6IPU0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CENPPQ6IPU0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CENPPQ6IPU0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPPQ6IPU0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPPQ6IPU0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPPQ6IPU0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPPQ6IPU0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPPQ6IPU0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPPQ6IPU0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPPQ6IPU0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPPQ6IPU0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPPQ6IPU0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPPQ6IPU0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPPQ6IPU0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPPQ6IPU0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPPQ6IPU0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPPQ6IPU0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPPQ6IPU0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPPQ6IPU0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPPQ6IPU0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPPQ6IPU0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPPQ6IPU0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CENPPQ6IPU0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CENPPQ6IPU0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CENPPQ6IPU0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CENPPQ6IPU0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CENPPQ6IPU0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPPQ6IPU0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPPQ6IPU0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPPQ6IPU0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPPQ6IPU0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPPQ6IPU0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPPQ6IPU0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPPQ6IPU0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPPQ6IPU0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPPQ6IPU0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPPQ6IPU0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPPQ6IPU0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPPQ6IPU0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPPQ6IPU0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPPQ6IPU0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPPQ6IPU0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPPQ6IPU0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPPQ6IPU0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPPQ6IPU0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPPQ6IPU0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPPQ6IPU0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPPQ6IPU0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPPQ6IPU0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPPQ6IPU0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPPQ6IPU0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPPQ6IPU0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms