Protein–RNA interactions for Protein: Q6IEE8

SLFN12L, Schlafen family member 12-like, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12LQ6IEE8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SLFN12LQ6IEE8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLFN12LQ6IEE8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLFN12LQ6IEE8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SLFN12LQ6IEE8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLFN12LQ6IEE8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLFN12LQ6IEE8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLFN12LQ6IEE8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLFN12LQ6IEE8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLFN12LQ6IEE8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLFN12LQ6IEE8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SLFN12LQ6IEE8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLFN12LQ6IEE8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLFN12LQ6IEE8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLFN12LQ6IEE8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLFN12LQ6IEE8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SLFN12LQ6IEE8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLFN12LQ6IEE8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SLFN12LQ6IEE8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLFN12LQ6IEE8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLFN12LQ6IEE8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLFN12LQ6IEE8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLFN12LQ6IEE8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLFN12LQ6IEE8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLFN12LQ6IEE8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLFN12LQ6IEE8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLFN12LQ6IEE8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLFN12LQ6IEE8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLFN12LQ6IEE8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLFN12LQ6IEE8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLFN12LQ6IEE8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLFN12LQ6IEE8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLFN12LQ6IEE8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLFN12LQ6IEE8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLFN12LQ6IEE8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN12LQ6IEE8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN12LQ6IEE8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN12LQ6IEE8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN12LQ6IEE8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN12LQ6IEE8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN12LQ6IEE8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN12LQ6IEE8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN12LQ6IEE8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN12LQ6IEE8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN12LQ6IEE8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN12LQ6IEE8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLFN12LQ6IEE8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLFN12LQ6IEE8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLFN12LQ6IEE8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLFN12LQ6IEE8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLFN12LQ6IEE8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLFN12LQ6IEE8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLFN12LQ6IEE8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SLFN12LQ6IEE8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLFN12LQ6IEE8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLFN12LQ6IEE8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLFN12LQ6IEE8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLFN12LQ6IEE8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SLFN12LQ6IEE8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLFN12LQ6IEE8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLFN12LQ6IEE8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLFN12LQ6IEE8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLFN12LQ6IEE8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLFN12LQ6IEE8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SLFN12LQ6IEE8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLFN12LQ6IEE8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLFN12LQ6IEE8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLFN12LQ6IEE8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLFN12LQ6IEE8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLFN12LQ6IEE8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLFN12LQ6IEE8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SLFN12LQ6IEE8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLFN12LQ6IEE8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLFN12LQ6IEE8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SLFN12LQ6IEE8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLFN12LQ6IEE8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLFN12LQ6IEE8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLFN12LQ6IEE8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLFN12LQ6IEE8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLFN12LQ6IEE8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLFN12LQ6IEE8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLFN12LQ6IEE8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLFN12LQ6IEE8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLFN12LQ6IEE8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLFN12LQ6IEE8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLFN12LQ6IEE8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLFN12LQ6IEE8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLFN12LQ6IEE8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SLFN12LQ6IEE8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLFN12LQ6IEE8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLFN12LQ6IEE8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLFN12LQ6IEE8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLFN12LQ6IEE8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLFN12LQ6IEE8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLFN12LQ6IEE8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLFN12LQ6IEE8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLFN12LQ6IEE8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLFN12LQ6IEE8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLFN12LQ6IEE8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLFN12LQ6IEE8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms