Protein–RNA interactions for Protein: Q6GPH4

XAF1, XIAP-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAF1Q6GPH4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XAF1Q6GPH4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XAF1Q6GPH4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XAF1Q6GPH4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XAF1Q6GPH4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XAF1Q6GPH4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XAF1Q6GPH4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XAF1Q6GPH4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XAF1Q6GPH4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XAF1Q6GPH4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
XAF1Q6GPH4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XAF1Q6GPH4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
XAF1Q6GPH4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XAF1Q6GPH4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XAF1Q6GPH4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XAF1Q6GPH4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XAF1Q6GPH4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XAF1Q6GPH4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XAF1Q6GPH4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XAF1Q6GPH4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XAF1Q6GPH4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XAF1Q6GPH4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XAF1Q6GPH4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XAF1Q6GPH4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XAF1Q6GPH4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XAF1Q6GPH4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XAF1Q6GPH4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XAF1Q6GPH4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
XAF1Q6GPH4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
XAF1Q6GPH4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XAF1Q6GPH4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
XAF1Q6GPH4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
XAF1Q6GPH4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
XAF1Q6GPH4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
XAF1Q6GPH4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
XAF1Q6GPH4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
XAF1Q6GPH4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
XAF1Q6GPH4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
XAF1Q6GPH4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
XAF1Q6GPH4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
XAF1Q6GPH4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
XAF1Q6GPH4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
XAF1Q6GPH4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XAF1Q6GPH4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XAF1Q6GPH4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XAF1Q6GPH4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
XAF1Q6GPH4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
XAF1Q6GPH4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XAF1Q6GPH4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
XAF1Q6GPH4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XAF1Q6GPH4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
XAF1Q6GPH4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XAF1Q6GPH4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XAF1Q6GPH4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
XAF1Q6GPH4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XAF1Q6GPH4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XAF1Q6GPH4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
XAF1Q6GPH4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
XAF1Q6GPH4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
XAF1Q6GPH4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
XAF1Q6GPH4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
XAF1Q6GPH4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
XAF1Q6GPH4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
XAF1Q6GPH4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
XAF1Q6GPH4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
XAF1Q6GPH4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
XAF1Q6GPH4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XAF1Q6GPH4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
XAF1Q6GPH4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XAF1Q6GPH4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XAF1Q6GPH4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XAF1Q6GPH4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XAF1Q6GPH4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XAF1Q6GPH4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XAF1Q6GPH4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XAF1Q6GPH4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XAF1Q6GPH4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XAF1Q6GPH4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XAF1Q6GPH4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XAF1Q6GPH4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XAF1Q6GPH4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XAF1Q6GPH4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XAF1Q6GPH4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
XAF1Q6GPH4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XAF1Q6GPH4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XAF1Q6GPH4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
XAF1Q6GPH4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
XAF1Q6GPH4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
XAF1Q6GPH4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XAF1Q6GPH4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XAF1Q6GPH4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XAF1Q6GPH4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XAF1Q6GPH4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XAF1Q6GPH4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
XAF1Q6GPH4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
XAF1Q6GPH4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
XAF1Q6GPH4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
XAF1Q6GPH4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
XAF1Q6GPH4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
XAF1Q6GPH4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms