Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LHX8Q68G74 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LHX8Q68G74 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LHX8Q68G74 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LHX8Q68G74 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LHX8Q68G74 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LHX8Q68G74 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LHX8Q68G74 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LHX8Q68G74 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LHX8Q68G74 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LHX8Q68G74 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LHX8Q68G74 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LHX8Q68G74 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LHX8Q68G74 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LHX8Q68G74 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LHX8Q68G74 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LHX8Q68G74 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LHX8Q68G74 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LHX8Q68G74 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LHX8Q68G74 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LHX8Q68G74 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LHX8Q68G74 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LHX8Q68G74 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LHX8Q68G74 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LHX8Q68G74 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LHX8Q68G74 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LHX8Q68G74 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LHX8Q68G74 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LHX8Q68G74 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LHX8Q68G74 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LHX8Q68G74 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LHX8Q68G74 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LHX8Q68G74 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LHX8Q68G74 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LHX8Q68G74 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LHX8Q68G74 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LHX8Q68G74 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LHX8Q68G74 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LHX8Q68G74 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LHX8Q68G74 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LHX8Q68G74 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LHX8Q68G74 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LHX8Q68G74 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LHX8Q68G74 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LHX8Q68G74 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LHX8Q68G74 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LHX8Q68G74 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LHX8Q68G74 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LHX8Q68G74 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LHX8Q68G74 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LHX8Q68G74 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LHX8Q68G74 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LHX8Q68G74 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LHX8Q68G74 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LHX8Q68G74 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LHX8Q68G74 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LHX8Q68G74 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LHX8Q68G74 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LHX8Q68G74 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LHX8Q68G74 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LHX8Q68G74 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LHX8Q68G74 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LHX8Q68G74 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LHX8Q68G74 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LHX8Q68G74 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LHX8Q68G74 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LHX8Q68G74 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LHX8Q68G74 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LHX8Q68G74 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LHX8Q68G74 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LHX8Q68G74 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LHX8Q68G74 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LHX8Q68G74 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LHX8Q68G74 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LHX8Q68G74 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LHX8Q68G74 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LHX8Q68G74 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LHX8Q68G74 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LHX8Q68G74 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LHX8Q68G74 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LHX8Q68G74 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LHX8Q68G74 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LHX8Q68G74 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LHX8Q68G74 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LHX8Q68G74 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
LHX8Q68G74 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LHX8Q68G74 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LHX8Q68G74 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LHX8Q68G74 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
LHX8Q68G74 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LHX8Q68G74 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LHX8Q68G74 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LHX8Q68G74 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LHX8Q68G74 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LHX8Q68G74 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LHX8Q68G74 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LHX8Q68G74 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LHX8Q68G74 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LHX8Q68G74 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LHX8Q68G74 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms