Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOCADQ5VW36 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
FOCADQ5VW36 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
FOCADQ5VW36 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
FOCADQ5VW36 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FOCADQ5VW36 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FOCADQ5VW36 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOCADQ5VW36 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
FOCADQ5VW36 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOCADQ5VW36 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOCADQ5VW36 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOCADQ5VW36 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOCADQ5VW36 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOCADQ5VW36 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOCADQ5VW36 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOCADQ5VW36 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOCADQ5VW36 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOCADQ5VW36 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOCADQ5VW36 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FOCADQ5VW36 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FOCADQ5VW36 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FOCADQ5VW36 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FOCADQ5VW36 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FOCADQ5VW36 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FOCADQ5VW36 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FOCADQ5VW36 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
FOCADQ5VW36 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FOCADQ5VW36 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FOCADQ5VW36 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FOCADQ5VW36 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FOCADQ5VW36 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FOCADQ5VW36 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FOCADQ5VW36 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FOCADQ5VW36 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FOCADQ5VW36 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FOCADQ5VW36 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FOCADQ5VW36 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FOCADQ5VW36 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FOCADQ5VW36 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FOCADQ5VW36 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FOCADQ5VW36 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
FOCADQ5VW36 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FOCADQ5VW36 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FOCADQ5VW36 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FOCADQ5VW36 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
FOCADQ5VW36 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FOCADQ5VW36 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FOCADQ5VW36 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FOCADQ5VW36 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FOCADQ5VW36 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FOCADQ5VW36 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FOCADQ5VW36 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FOCADQ5VW36 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FOCADQ5VW36 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOCADQ5VW36 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOCADQ5VW36 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOCADQ5VW36 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOCADQ5VW36 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOCADQ5VW36 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOCADQ5VW36 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FOCADQ5VW36 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FOCADQ5VW36 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FOCADQ5VW36 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FOCADQ5VW36 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FOCADQ5VW36 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FOCADQ5VW36 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FOCADQ5VW36 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FOCADQ5VW36 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FOCADQ5VW36 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FOCADQ5VW36 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FOCADQ5VW36 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FOCADQ5VW36 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOCADQ5VW36 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOCADQ5VW36 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOCADQ5VW36 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOCADQ5VW36 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOCADQ5VW36 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOCADQ5VW36 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOCADQ5VW36 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOCADQ5VW36 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOCADQ5VW36 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
FOCADQ5VW36 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
FOCADQ5VW36 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
FOCADQ5VW36 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FOCADQ5VW36 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FOCADQ5VW36 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FOCADQ5VW36 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FOCADQ5VW36 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FOCADQ5VW36 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FOCADQ5VW36 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FOCADQ5VW36 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FOCADQ5VW36 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FOCADQ5VW36 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FOCADQ5VW36 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FOCADQ5VW36 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FOCADQ5VW36 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FOCADQ5VW36 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FOCADQ5VW36 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FOCADQ5VW36 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FOCADQ5VW36 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms