Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTE0

EEF1A1P5, Putative elongation factor 1-alpha-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P5Q5VTE0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EEF1A1P5Q5VTE0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EEF1A1P5Q5VTE0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EEF1A1P5Q5VTE0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EEF1A1P5Q5VTE0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EEF1A1P5Q5VTE0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EEF1A1P5Q5VTE0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
EEF1A1P5Q5VTE0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EEF1A1P5Q5VTE0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EEF1A1P5Q5VTE0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EEF1A1P5Q5VTE0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EEF1A1P5Q5VTE0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EEF1A1P5Q5VTE0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EEF1A1P5Q5VTE0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EEF1A1P5Q5VTE0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EEF1A1P5Q5VTE0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
EEF1A1P5Q5VTE0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EEF1A1P5Q5VTE0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EEF1A1P5Q5VTE0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EEF1A1P5Q5VTE0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EEF1A1P5Q5VTE0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EEF1A1P5Q5VTE0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EEF1A1P5Q5VTE0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EEF1A1P5Q5VTE0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EEF1A1P5Q5VTE0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EEF1A1P5Q5VTE0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EEF1A1P5Q5VTE0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EEF1A1P5Q5VTE0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EEF1A1P5Q5VTE0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EEF1A1P5Q5VTE0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EEF1A1P5Q5VTE0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EEF1A1P5Q5VTE0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EEF1A1P5Q5VTE0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EEF1A1P5Q5VTE0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EEF1A1P5Q5VTE0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EEF1A1P5Q5VTE0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EEF1A1P5Q5VTE0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EEF1A1P5Q5VTE0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
EEF1A1P5Q5VTE0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EEF1A1P5Q5VTE0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
EEF1A1P5Q5VTE0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EEF1A1P5Q5VTE0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EEF1A1P5Q5VTE0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EEF1A1P5Q5VTE0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
EEF1A1P5Q5VTE0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
EEF1A1P5Q5VTE0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EEF1A1P5Q5VTE0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EEF1A1P5Q5VTE0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EEF1A1P5Q5VTE0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EEF1A1P5Q5VTE0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EEF1A1P5Q5VTE0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EEF1A1P5Q5VTE0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EEF1A1P5Q5VTE0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEF1A1P5Q5VTE0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEF1A1P5Q5VTE0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEF1A1P5Q5VTE0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEF1A1P5Q5VTE0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEF1A1P5Q5VTE0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEF1A1P5Q5VTE0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEF1A1P5Q5VTE0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEF1A1P5Q5VTE0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EEF1A1P5Q5VTE0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EEF1A1P5Q5VTE0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EEF1A1P5Q5VTE0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EEF1A1P5Q5VTE0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EEF1A1P5Q5VTE0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EEF1A1P5Q5VTE0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EEF1A1P5Q5VTE0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EEF1A1P5Q5VTE0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EEF1A1P5Q5VTE0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EEF1A1P5Q5VTE0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EEF1A1P5Q5VTE0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EEF1A1P5Q5VTE0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EEF1A1P5Q5VTE0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EEF1A1P5Q5VTE0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EEF1A1P5Q5VTE0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EEF1A1P5Q5VTE0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EEF1A1P5Q5VTE0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EEF1A1P5Q5VTE0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EEF1A1P5Q5VTE0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EEF1A1P5Q5VTE0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EEF1A1P5Q5VTE0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EEF1A1P5Q5VTE0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EEF1A1P5Q5VTE0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EEF1A1P5Q5VTE0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EEF1A1P5Q5VTE0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EEF1A1P5Q5VTE0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EEF1A1P5Q5VTE0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EEF1A1P5Q5VTE0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms