Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GFI1BQ5VTD9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GFI1BQ5VTD9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GFI1BQ5VTD9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GFI1BQ5VTD9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GFI1BQ5VTD9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GFI1BQ5VTD9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GFI1BQ5VTD9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GFI1BQ5VTD9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GFI1BQ5VTD9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GFI1BQ5VTD9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GFI1BQ5VTD9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GFI1BQ5VTD9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GFI1BQ5VTD9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GFI1BQ5VTD9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GFI1BQ5VTD9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GFI1BQ5VTD9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GFI1BQ5VTD9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GFI1BQ5VTD9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GFI1BQ5VTD9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GFI1BQ5VTD9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GFI1BQ5VTD9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GFI1BQ5VTD9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GFI1BQ5VTD9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GFI1BQ5VTD9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GFI1BQ5VTD9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GFI1BQ5VTD9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GFI1BQ5VTD9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GFI1BQ5VTD9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GFI1BQ5VTD9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GFI1BQ5VTD9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GFI1BQ5VTD9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GFI1BQ5VTD9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GFI1BQ5VTD9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GFI1BQ5VTD9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GFI1BQ5VTD9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GFI1BQ5VTD9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GFI1BQ5VTD9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GFI1BQ5VTD9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GFI1BQ5VTD9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GFI1BQ5VTD9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GFI1BQ5VTD9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GFI1BQ5VTD9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GFI1BQ5VTD9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GFI1BQ5VTD9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GFI1BQ5VTD9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GFI1BQ5VTD9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GFI1BQ5VTD9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GFI1BQ5VTD9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GFI1BQ5VTD9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GFI1BQ5VTD9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GFI1BQ5VTD9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GFI1BQ5VTD9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GFI1BQ5VTD9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GFI1BQ5VTD9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GFI1BQ5VTD9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GFI1BQ5VTD9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GFI1BQ5VTD9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GFI1BQ5VTD9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GFI1BQ5VTD9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GFI1BQ5VTD9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GFI1BQ5VTD9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GFI1BQ5VTD9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GFI1BQ5VTD9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GFI1BQ5VTD9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GFI1BQ5VTD9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GFI1BQ5VTD9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GFI1BQ5VTD9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GFI1BQ5VTD9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GFI1BQ5VTD9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GFI1BQ5VTD9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GFI1BQ5VTD9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GFI1BQ5VTD9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GFI1BQ5VTD9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GFI1BQ5VTD9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GFI1BQ5VTD9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GFI1BQ5VTD9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GFI1BQ5VTD9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GFI1BQ5VTD9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GFI1BQ5VTD9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GFI1BQ5VTD9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GFI1BQ5VTD9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GFI1BQ5VTD9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GFI1BQ5VTD9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GFI1BQ5VTD9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GFI1BQ5VTD9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GFI1BQ5VTD9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFI1BQ5VTD9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFI1BQ5VTD9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFI1BQ5VTD9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GFI1BQ5VTD9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFI1BQ5VTD9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFI1BQ5VTD9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFI1BQ5VTD9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFI1BQ5VTD9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFI1BQ5VTD9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFI1BQ5VTD9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFI1BQ5VTD9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFI1BQ5VTD9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFI1BQ5VTD9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms