Protein–RNA interactions for Protein: Q5TA50

CPTP, Ceramide-1-phosphate transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPTPQ5TA50 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPTPQ5TA50 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPTPQ5TA50 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPTPQ5TA50 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPTPQ5TA50 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPTPQ5TA50 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPTPQ5TA50 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPTPQ5TA50 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPTPQ5TA50 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPTPQ5TA50 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPTPQ5TA50 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPTPQ5TA50 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPTPQ5TA50 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPTPQ5TA50 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPTPQ5TA50 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPTPQ5TA50 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CPTPQ5TA50 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPTPQ5TA50 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPTPQ5TA50 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPTPQ5TA50 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPTPQ5TA50 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPTPQ5TA50 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPTPQ5TA50 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPTPQ5TA50 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPTPQ5TA50 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CPTPQ5TA50 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPTPQ5TA50 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CPTPQ5TA50 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPTPQ5TA50 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPTPQ5TA50 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CPTPQ5TA50 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPTPQ5TA50 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPTPQ5TA50 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPTPQ5TA50 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPTPQ5TA50 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPTPQ5TA50 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPTPQ5TA50 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPTPQ5TA50 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPTPQ5TA50 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPTPQ5TA50 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPTPQ5TA50 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPTPQ5TA50 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPTPQ5TA50 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPTPQ5TA50 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPTPQ5TA50 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPTPQ5TA50 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPTPQ5TA50 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPTPQ5TA50 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPTPQ5TA50 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPTPQ5TA50 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CPTPQ5TA50 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPTPQ5TA50 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPTPQ5TA50 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPTPQ5TA50 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPTPQ5TA50 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPTPQ5TA50 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPTPQ5TA50 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPTPQ5TA50 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CPTPQ5TA50 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPTPQ5TA50 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPTPQ5TA50 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPTPQ5TA50 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPTPQ5TA50 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPTPQ5TA50 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPTPQ5TA50 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPTPQ5TA50 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPTPQ5TA50 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPTPQ5TA50 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPTPQ5TA50 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPTPQ5TA50 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CPTPQ5TA50 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CPTPQ5TA50 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPTPQ5TA50 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPTPQ5TA50 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPTPQ5TA50 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPTPQ5TA50 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CPTPQ5TA50 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CPTPQ5TA50 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPTPQ5TA50 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPTPQ5TA50 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPTPQ5TA50 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CPTPQ5TA50 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPTPQ5TA50 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPTPQ5TA50 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CPTPQ5TA50 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPTPQ5TA50 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPTPQ5TA50 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPTPQ5TA50 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPTPQ5TA50 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPTPQ5TA50 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPTPQ5TA50 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPTPQ5TA50 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPTPQ5TA50 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPTPQ5TA50 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPTPQ5TA50 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPTPQ5TA50 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPTPQ5TA50 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPTPQ5TA50 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPTPQ5TA50 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPTPQ5TA50 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms