Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LDLRAD1Q5T700 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LDLRAD1Q5T700 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LDLRAD1Q5T700 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LDLRAD1Q5T700 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LDLRAD1Q5T700 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LDLRAD1Q5T700 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LDLRAD1Q5T700 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LDLRAD1Q5T700 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LDLRAD1Q5T700 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LDLRAD1Q5T700 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LDLRAD1Q5T700 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LDLRAD1Q5T700 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LDLRAD1Q5T700 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LDLRAD1Q5T700 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LDLRAD1Q5T700 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LDLRAD1Q5T700 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LDLRAD1Q5T700 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LDLRAD1Q5T700 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LDLRAD1Q5T700 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LDLRAD1Q5T700 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LDLRAD1Q5T700 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LDLRAD1Q5T700 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LDLRAD1Q5T700 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LDLRAD1Q5T700 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LDLRAD1Q5T700 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LDLRAD1Q5T700 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LDLRAD1Q5T700 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
LDLRAD1Q5T700 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LDLRAD1Q5T700 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
LDLRAD1Q5T700 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LDLRAD1Q5T700 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LDLRAD1Q5T700 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LDLRAD1Q5T700 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LDLRAD1Q5T700 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LDLRAD1Q5T700 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LDLRAD1Q5T700 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LDLRAD1Q5T700 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LDLRAD1Q5T700 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
LDLRAD1Q5T700 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LDLRAD1Q5T700 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LDLRAD1Q5T700 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LDLRAD1Q5T700 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LDLRAD1Q5T700 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
LDLRAD1Q5T700 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LDLRAD1Q5T700 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LDLRAD1Q5T700 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LDLRAD1Q5T700 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LDLRAD1Q5T700 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LDLRAD1Q5T700 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LDLRAD1Q5T700 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LDLRAD1Q5T700 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LDLRAD1Q5T700 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LDLRAD1Q5T700 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
LDLRAD1Q5T700 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LDLRAD1Q5T700 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LDLRAD1Q5T700 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LDLRAD1Q5T700 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LDLRAD1Q5T700 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LDLRAD1Q5T700 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LDLRAD1Q5T700 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LDLRAD1Q5T700 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LDLRAD1Q5T700 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
LDLRAD1Q5T700 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LDLRAD1Q5T700 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LDLRAD1Q5T700 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LDLRAD1Q5T700 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LDLRAD1Q5T700 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LDLRAD1Q5T700 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LDLRAD1Q5T700 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
LDLRAD1Q5T700 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LDLRAD1Q5T700 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LDLRAD1Q5T700 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LDLRAD1Q5T700 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LDLRAD1Q5T700 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LDLRAD1Q5T700 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LDLRAD1Q5T700 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LDLRAD1Q5T700 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
LDLRAD1Q5T700 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LDLRAD1Q5T700 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LDLRAD1Q5T700 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LDLRAD1Q5T700 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LDLRAD1Q5T700 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LDLRAD1Q5T700 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LDLRAD1Q5T700 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LDLRAD1Q5T700 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LDLRAD1Q5T700 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LDLRAD1Q5T700 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
LDLRAD1Q5T700 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
LDLRAD1Q5T700 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
LDLRAD1Q5T700 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
LDLRAD1Q5T700 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LDLRAD1Q5T700 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LDLRAD1Q5T700 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LDLRAD1Q5T700 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LDLRAD1Q5T700 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LDLRAD1Q5T700 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LDLRAD1Q5T700 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LDLRAD1Q5T700 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LDLRAD1Q5T700 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms