Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5M9

CCNJ, Cyclin-J, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNJQ5T5M9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNJQ5T5M9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNJQ5T5M9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNJQ5T5M9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNJQ5T5M9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNJQ5T5M9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNJQ5T5M9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNJQ5T5M9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNJQ5T5M9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNJQ5T5M9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNJQ5T5M9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNJQ5T5M9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNJQ5T5M9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNJQ5T5M9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNJQ5T5M9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNJQ5T5M9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNJQ5T5M9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNJQ5T5M9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNJQ5T5M9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNJQ5T5M9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNJQ5T5M9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNJQ5T5M9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNJQ5T5M9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNJQ5T5M9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNJQ5T5M9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNJQ5T5M9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNJQ5T5M9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNJQ5T5M9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNJQ5T5M9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNJQ5T5M9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNJQ5T5M9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNJQ5T5M9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNJQ5T5M9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNJQ5T5M9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNJQ5T5M9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNJQ5T5M9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNJQ5T5M9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNJQ5T5M9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNJQ5T5M9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNJQ5T5M9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNJQ5T5M9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNJQ5T5M9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNJQ5T5M9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNJQ5T5M9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNJQ5T5M9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNJQ5T5M9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNJQ5T5M9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNJQ5T5M9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNJQ5T5M9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNJQ5T5M9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNJQ5T5M9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNJQ5T5M9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNJQ5T5M9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNJQ5T5M9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNJQ5T5M9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNJQ5T5M9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNJQ5T5M9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNJQ5T5M9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNJQ5T5M9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNJQ5T5M9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNJQ5T5M9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNJQ5T5M9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNJQ5T5M9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNJQ5T5M9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNJQ5T5M9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNJQ5T5M9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNJQ5T5M9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNJQ5T5M9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNJQ5T5M9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNJQ5T5M9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNJQ5T5M9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNJQ5T5M9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNJQ5T5M9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNJQ5T5M9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNJQ5T5M9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNJQ5T5M9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNJQ5T5M9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNJQ5T5M9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNJQ5T5M9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNJQ5T5M9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNJQ5T5M9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNJQ5T5M9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNJQ5T5M9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNJQ5T5M9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNJQ5T5M9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNJQ5T5M9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNJQ5T5M9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNJQ5T5M9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNJQ5T5M9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNJQ5T5M9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNJQ5T5M9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNJQ5T5M9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNJQ5T5M9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNJQ5T5M9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNJQ5T5M9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNJQ5T5M9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNJQ5T5M9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNJQ5T5M9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNJQ5T5M9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNJQ5T5M9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
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