Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HIVEP3Q5T1R4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIVEP3Q5T1R4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIVEP3Q5T1R4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIVEP3Q5T1R4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIVEP3Q5T1R4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIVEP3Q5T1R4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HIVEP3Q5T1R4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIVEP3Q5T1R4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIVEP3Q5T1R4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIVEP3Q5T1R4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIVEP3Q5T1R4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIVEP3Q5T1R4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HIVEP3Q5T1R4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIVEP3Q5T1R4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIVEP3Q5T1R4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIVEP3Q5T1R4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIVEP3Q5T1R4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIVEP3Q5T1R4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIVEP3Q5T1R4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIVEP3Q5T1R4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIVEP3Q5T1R4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HIVEP3Q5T1R4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIVEP3Q5T1R4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIVEP3Q5T1R4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIVEP3Q5T1R4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIVEP3Q5T1R4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIVEP3Q5T1R4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIVEP3Q5T1R4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIVEP3Q5T1R4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIVEP3Q5T1R4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIVEP3Q5T1R4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIVEP3Q5T1R4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIVEP3Q5T1R4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HIVEP3Q5T1R4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIVEP3Q5T1R4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIVEP3Q5T1R4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIVEP3Q5T1R4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIVEP3Q5T1R4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HIVEP3Q5T1R4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIVEP3Q5T1R4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HIVEP3Q5T1R4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIVEP3Q5T1R4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIVEP3Q5T1R4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIVEP3Q5T1R4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIVEP3Q5T1R4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIVEP3Q5T1R4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIVEP3Q5T1R4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIVEP3Q5T1R4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIVEP3Q5T1R4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIVEP3Q5T1R4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIVEP3Q5T1R4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIVEP3Q5T1R4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIVEP3Q5T1R4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIVEP3Q5T1R4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIVEP3Q5T1R4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIVEP3Q5T1R4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIVEP3Q5T1R4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIVEP3Q5T1R4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIVEP3Q5T1R4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIVEP3Q5T1R4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIVEP3Q5T1R4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIVEP3Q5T1R4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIVEP3Q5T1R4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIVEP3Q5T1R4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIVEP3Q5T1R4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIVEP3Q5T1R4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIVEP3Q5T1R4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIVEP3Q5T1R4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIVEP3Q5T1R4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIVEP3Q5T1R4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIVEP3Q5T1R4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HIVEP3Q5T1R4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HIVEP3Q5T1R4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HIVEP3Q5T1R4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HIVEP3Q5T1R4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIVEP3Q5T1R4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIVEP3Q5T1R4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIVEP3Q5T1R4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIVEP3Q5T1R4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIVEP3Q5T1R4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HIVEP3Q5T1R4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIVEP3Q5T1R4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIVEP3Q5T1R4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HIVEP3Q5T1R4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HIVEP3Q5T1R4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HIVEP3Q5T1R4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HIVEP3Q5T1R4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HIVEP3Q5T1R4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HIVEP3Q5T1R4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HIVEP3Q5T1R4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIVEP3Q5T1R4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIVEP3Q5T1R4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIVEP3Q5T1R4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIVEP3Q5T1R4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIVEP3Q5T1R4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIVEP3Q5T1R4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIVEP3Q5T1R4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIVEP3Q5T1R4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIVEP3Q5T1R4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms