Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAPCD1Q5SSQ6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAPCD1Q5SSQ6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAPCD1Q5SSQ6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAPCD1Q5SSQ6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAPCD1Q5SSQ6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAPCD1Q5SSQ6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAPCD1Q5SSQ6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAPCD1Q5SSQ6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAPCD1Q5SSQ6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAPCD1Q5SSQ6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms