Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQQ9

VAX1, Ventral anterior homeobox 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX1Q5SQQ9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAX1Q5SQQ9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAX1Q5SQQ9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAX1Q5SQQ9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAX1Q5SQQ9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAX1Q5SQQ9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAX1Q5SQQ9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAX1Q5SQQ9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAX1Q5SQQ9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
VAX1Q5SQQ9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAX1Q5SQQ9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAX1Q5SQQ9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAX1Q5SQQ9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAX1Q5SQQ9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAX1Q5SQQ9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAX1Q5SQQ9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAX1Q5SQQ9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAX1Q5SQQ9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAX1Q5SQQ9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAX1Q5SQQ9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAX1Q5SQQ9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAX1Q5SQQ9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAX1Q5SQQ9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAX1Q5SQQ9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAX1Q5SQQ9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAX1Q5SQQ9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAX1Q5SQQ9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAX1Q5SQQ9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAX1Q5SQQ9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
VAX1Q5SQQ9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
VAX1Q5SQQ9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAX1Q5SQQ9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAX1Q5SQQ9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
VAX1Q5SQQ9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAX1Q5SQQ9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAX1Q5SQQ9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAX1Q5SQQ9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAX1Q5SQQ9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAX1Q5SQQ9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAX1Q5SQQ9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAX1Q5SQQ9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAX1Q5SQQ9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAX1Q5SQQ9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAX1Q5SQQ9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAX1Q5SQQ9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAX1Q5SQQ9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAX1Q5SQQ9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAX1Q5SQQ9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAX1Q5SQQ9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAX1Q5SQQ9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAX1Q5SQQ9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAX1Q5SQQ9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAX1Q5SQQ9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAX1Q5SQQ9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAX1Q5SQQ9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAX1Q5SQQ9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAX1Q5SQQ9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAX1Q5SQQ9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAX1Q5SQQ9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAX1Q5SQQ9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAX1Q5SQQ9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
VAX1Q5SQQ9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAX1Q5SQQ9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAX1Q5SQQ9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAX1Q5SQQ9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAX1Q5SQQ9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAX1Q5SQQ9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAX1Q5SQQ9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAX1Q5SQQ9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAX1Q5SQQ9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAX1Q5SQQ9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAX1Q5SQQ9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAX1Q5SQQ9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAX1Q5SQQ9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAX1Q5SQQ9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAX1Q5SQQ9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAX1Q5SQQ9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAX1Q5SQQ9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAX1Q5SQQ9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAX1Q5SQQ9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAX1Q5SQQ9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAX1Q5SQQ9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAX1Q5SQQ9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAX1Q5SQQ9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAX1Q5SQQ9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAX1Q5SQQ9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAX1Q5SQQ9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VAX1Q5SQQ9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
VAX1Q5SQQ9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VAX1Q5SQQ9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VAX1Q5SQQ9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
VAX1Q5SQQ9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAX1Q5SQQ9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAX1Q5SQQ9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAX1Q5SQQ9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAX1Q5SQQ9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAX1Q5SQQ9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAX1Q5SQQ9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAX1Q5SQQ9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAX1Q5SQQ9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms