Protein–RNA interactions for Protein: Q5RGS3

FAM74A1, Protein FAM74A1, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A1Q5RGS3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM74A1Q5RGS3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM74A1Q5RGS3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM74A1Q5RGS3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM74A1Q5RGS3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM74A1Q5RGS3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM74A1Q5RGS3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM74A1Q5RGS3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM74A1Q5RGS3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM74A1Q5RGS3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM74A1Q5RGS3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM74A1Q5RGS3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM74A1Q5RGS3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM74A1Q5RGS3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM74A1Q5RGS3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM74A1Q5RGS3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM74A1Q5RGS3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM74A1Q5RGS3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM74A1Q5RGS3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM74A1Q5RGS3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FAM74A1Q5RGS3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
FAM74A1Q5RGS3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FAM74A1Q5RGS3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM74A1Q5RGS3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM74A1Q5RGS3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM74A1Q5RGS3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM74A1Q5RGS3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM74A1Q5RGS3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM74A1Q5RGS3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM74A1Q5RGS3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM74A1Q5RGS3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM74A1Q5RGS3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM74A1Q5RGS3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM74A1Q5RGS3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms