Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP78Q5JTW2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEP78Q5JTW2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP78Q5JTW2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP78Q5JTW2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP78Q5JTW2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP78Q5JTW2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP78Q5JTW2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP78Q5JTW2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP78Q5JTW2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP78Q5JTW2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP78Q5JTW2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP78Q5JTW2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CEP78Q5JTW2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEP78Q5JTW2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CEP78Q5JTW2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CEP78Q5JTW2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CEP78Q5JTW2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP78Q5JTW2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP78Q5JTW2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CEP78Q5JTW2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP78Q5JTW2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP78Q5JTW2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP78Q5JTW2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CEP78Q5JTW2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CEP78Q5JTW2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP78Q5JTW2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP78Q5JTW2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CEP78Q5JTW2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CEP78Q5JTW2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CEP78Q5JTW2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP78Q5JTW2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CEP78Q5JTW2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CEP78Q5JTW2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEP78Q5JTW2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEP78Q5JTW2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP78Q5JTW2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP78Q5JTW2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP78Q5JTW2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEP78Q5JTW2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms