Protein–RNA interactions for Protein: Q5JT25

RAB41, Ras-related protein Rab-41, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB41Q5JT25 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB41Q5JT25 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB41Q5JT25 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB41Q5JT25 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB41Q5JT25 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB41Q5JT25 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB41Q5JT25 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB41Q5JT25 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB41Q5JT25 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB41Q5JT25 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB41Q5JT25 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB41Q5JT25 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB41Q5JT25 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB41Q5JT25 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB41Q5JT25 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB41Q5JT25 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB41Q5JT25 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB41Q5JT25 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB41Q5JT25 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB41Q5JT25 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB41Q5JT25 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB41Q5JT25 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB41Q5JT25 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB41Q5JT25 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB41Q5JT25 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB41Q5JT25 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB41Q5JT25 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB41Q5JT25 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB41Q5JT25 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB41Q5JT25 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB41Q5JT25 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB41Q5JT25 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB41Q5JT25 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB41Q5JT25 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB41Q5JT25 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB41Q5JT25 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB41Q5JT25 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB41Q5JT25 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB41Q5JT25 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB41Q5JT25 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB41Q5JT25 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB41Q5JT25 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB41Q5JT25 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB41Q5JT25 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB41Q5JT25 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB41Q5JT25 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB41Q5JT25 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB41Q5JT25 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB41Q5JT25 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB41Q5JT25 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB41Q5JT25 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB41Q5JT25 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB41Q5JT25 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB41Q5JT25 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB41Q5JT25 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB41Q5JT25 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB41Q5JT25 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB41Q5JT25 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB41Q5JT25 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB41Q5JT25 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB41Q5JT25 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB41Q5JT25 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB41Q5JT25 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB41Q5JT25 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB41Q5JT25 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB41Q5JT25 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB41Q5JT25 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB41Q5JT25 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB41Q5JT25 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB41Q5JT25 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB41Q5JT25 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB41Q5JT25 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB41Q5JT25 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB41Q5JT25 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB41Q5JT25 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB41Q5JT25 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB41Q5JT25 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB41Q5JT25 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB41Q5JT25 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB41Q5JT25 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB41Q5JT25 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB41Q5JT25 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB41Q5JT25 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB41Q5JT25 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB41Q5JT25 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB41Q5JT25 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB41Q5JT25 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB41Q5JT25 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB41Q5JT25 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB41Q5JT25 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB41Q5JT25 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB41Q5JT25 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB41Q5JT25 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB41Q5JT25 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB41Q5JT25 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB41Q5JT25 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB41Q5JT25 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB41Q5JT25 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB41Q5JT25 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB41Q5JT25 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.6 ms