Protein–RNA interactions for Protein: Q5IJ48

CRB2, Protein crumbs homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB2Q5IJ48 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRB2Q5IJ48 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRB2Q5IJ48 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRB2Q5IJ48 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRB2Q5IJ48 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRB2Q5IJ48 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRB2Q5IJ48 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRB2Q5IJ48 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRB2Q5IJ48 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRB2Q5IJ48 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRB2Q5IJ48 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRB2Q5IJ48 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRB2Q5IJ48 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRB2Q5IJ48 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRB2Q5IJ48 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRB2Q5IJ48 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRB2Q5IJ48 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRB2Q5IJ48 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRB2Q5IJ48 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRB2Q5IJ48 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRB2Q5IJ48 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRB2Q5IJ48 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CRB2Q5IJ48 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRB2Q5IJ48 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRB2Q5IJ48 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRB2Q5IJ48 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRB2Q5IJ48 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CRB2Q5IJ48 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRB2Q5IJ48 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRB2Q5IJ48 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRB2Q5IJ48 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRB2Q5IJ48 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRB2Q5IJ48 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRB2Q5IJ48 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRB2Q5IJ48 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRB2Q5IJ48 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRB2Q5IJ48 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRB2Q5IJ48 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRB2Q5IJ48 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRB2Q5IJ48 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRB2Q5IJ48 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRB2Q5IJ48 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRB2Q5IJ48 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CRB2Q5IJ48 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CRB2Q5IJ48 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRB2Q5IJ48 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRB2Q5IJ48 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 518.9 ms