Protein–RNA interactions for Protein: Q5H9R7

PPP6R3, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP6R3Q5H9R7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP6R3Q5H9R7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PPP6R3Q5H9R7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PPP6R3Q5H9R7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PPP6R3Q5H9R7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP6R3Q5H9R7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP6R3Q5H9R7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP6R3Q5H9R7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP6R3Q5H9R7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP6R3Q5H9R7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP6R3Q5H9R7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP6R3Q5H9R7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP6R3Q5H9R7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP6R3Q5H9R7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP6R3Q5H9R7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP6R3Q5H9R7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPP6R3Q5H9R7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPP6R3Q5H9R7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPP6R3Q5H9R7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP6R3Q5H9R7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP6R3Q5H9R7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP6R3Q5H9R7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP6R3Q5H9R7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP6R3Q5H9R7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP6R3Q5H9R7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP6R3Q5H9R7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PPP6R3Q5H9R7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PPP6R3Q5H9R7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPP6R3Q5H9R7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPP6R3Q5H9R7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPP6R3Q5H9R7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPP6R3Q5H9R7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP6R3Q5H9R7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP6R3Q5H9R7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP6R3Q5H9R7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP6R3Q5H9R7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP6R3Q5H9R7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP6R3Q5H9R7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP6R3Q5H9R7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP6R3Q5H9R7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP6R3Q5H9R7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP6R3Q5H9R7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP6R3Q5H9R7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP6R3Q5H9R7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP6R3Q5H9R7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP6R3Q5H9R7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP6R3Q5H9R7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP6R3Q5H9R7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP6R3Q5H9R7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP6R3Q5H9R7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP6R3Q5H9R7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP6R3Q5H9R7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP6R3Q5H9R7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP6R3Q5H9R7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP6R3Q5H9R7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP6R3Q5H9R7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP6R3Q5H9R7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP6R3Q5H9R7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP6R3Q5H9R7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP6R3Q5H9R7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP6R3Q5H9R7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP6R3Q5H9R7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP6R3Q5H9R7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP6R3Q5H9R7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP6R3Q5H9R7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP6R3Q5H9R7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP6R3Q5H9R7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP6R3Q5H9R7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP6R3Q5H9R7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP6R3Q5H9R7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP6R3Q5H9R7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP6R3Q5H9R7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP6R3Q5H9R7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP6R3Q5H9R7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP6R3Q5H9R7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP6R3Q5H9R7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP6R3Q5H9R7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP6R3Q5H9R7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP6R3Q5H9R7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP6R3Q5H9R7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP6R3Q5H9R7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP6R3Q5H9R7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP6R3Q5H9R7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP6R3Q5H9R7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP6R3Q5H9R7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP6R3Q5H9R7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP6R3Q5H9R7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP6R3Q5H9R7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP6R3Q5H9R7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP6R3Q5H9R7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP6R3Q5H9R7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP6R3Q5H9R7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP6R3Q5H9R7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP6R3Q5H9R7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP6R3Q5H9R7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP6R3Q5H9R7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP6R3Q5H9R7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP6R3Q5H9R7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP6R3Q5H9R7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP6R3Q5H9R7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms