Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD39Q53RE8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD39Q53RE8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD39Q53RE8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD39Q53RE8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD39Q53RE8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD39Q53RE8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD39Q53RE8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD39Q53RE8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD39Q53RE8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD39Q53RE8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD39Q53RE8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD39Q53RE8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD39Q53RE8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD39Q53RE8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD39Q53RE8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD39Q53RE8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD39Q53RE8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD39Q53RE8 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD39Q53RE8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD39Q53RE8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD39Q53RE8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD39Q53RE8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD39Q53RE8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD39Q53RE8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD39Q53RE8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD39Q53RE8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD39Q53RE8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD39Q53RE8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD39Q53RE8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD39Q53RE8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ANKRD39Q53RE8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ANKRD39Q53RE8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms