Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C4orf46Q504U0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C4orf46Q504U0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C4orf46Q504U0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C4orf46Q504U0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
C4orf46Q504U0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C4orf46Q504U0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C4orf46Q504U0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C4orf46Q504U0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C4orf46Q504U0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C4orf46Q504U0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C4orf46Q504U0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
C4orf46Q504U0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C4orf46Q504U0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C4orf46Q504U0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C4orf46Q504U0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C4orf46Q504U0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C4orf46Q504U0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C4orf46Q504U0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C4orf46Q504U0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
C4orf46Q504U0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C4orf46Q504U0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C4orf46Q504U0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C4orf46Q504U0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C4orf46Q504U0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C4orf46Q504U0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C4orf46Q504U0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C4orf46Q504U0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C4orf46Q504U0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C4orf46Q504U0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
C4orf46Q504U0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4orf46Q504U0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4orf46Q504U0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4orf46Q504U0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4orf46Q504U0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4orf46Q504U0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4orf46Q504U0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4orf46Q504U0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4orf46Q504U0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4orf46Q504U0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4orf46Q504U0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4orf46Q504U0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
C4orf46Q504U0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4orf46Q504U0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4orf46Q504U0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4orf46Q504U0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C4orf46Q504U0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
C4orf46Q504U0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C4orf46Q504U0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C4orf46Q504U0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C4orf46Q504U0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C4orf46Q504U0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C4orf46Q504U0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C4orf46Q504U0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C4orf46Q504U0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
C4orf46Q504U0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C4orf46Q504U0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C4orf46Q504U0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C4orf46Q504U0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C4orf46Q504U0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C4orf46Q504U0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C4orf46Q504U0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C4orf46Q504U0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C4orf46Q504U0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C4orf46Q504U0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C4orf46Q504U0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C4orf46Q504U0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C4orf46Q504U0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4orf46Q504U0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4orf46Q504U0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4orf46Q504U0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4orf46Q504U0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4orf46Q504U0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4orf46Q504U0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C4orf46Q504U0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C4orf46Q504U0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C4orf46Q504U0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C4orf46Q504U0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C4orf46Q504U0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C4orf46Q504U0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C4orf46Q504U0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
C4orf46Q504U0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
C4orf46Q504U0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
C4orf46Q504U0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C4orf46Q504U0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C4orf46Q504U0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C4orf46Q504U0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C4orf46Q504U0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C4orf46Q504U0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C4orf46Q504U0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C4orf46Q504U0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C4orf46Q504U0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C4orf46Q504U0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
C4orf46Q504U0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C4orf46Q504U0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C4orf46Q504U0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C4orf46Q504U0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C4orf46Q504U0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C4orf46Q504U0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C4orf46Q504U0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms