Protein–RNA interactions for Protein: Q502W6

VWA3B, von Willebrand factor A domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3BQ502W6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VWA3BQ502W6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VWA3BQ502W6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VWA3BQ502W6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VWA3BQ502W6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VWA3BQ502W6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VWA3BQ502W6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VWA3BQ502W6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
VWA3BQ502W6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VWA3BQ502W6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VWA3BQ502W6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VWA3BQ502W6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VWA3BQ502W6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VWA3BQ502W6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VWA3BQ502W6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VWA3BQ502W6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VWA3BQ502W6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VWA3BQ502W6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VWA3BQ502W6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VWA3BQ502W6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VWA3BQ502W6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VWA3BQ502W6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VWA3BQ502W6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VWA3BQ502W6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VWA3BQ502W6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VWA3BQ502W6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VWA3BQ502W6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
VWA3BQ502W6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VWA3BQ502W6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VWA3BQ502W6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VWA3BQ502W6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
VWA3BQ502W6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VWA3BQ502W6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VWA3BQ502W6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VWA3BQ502W6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
VWA3BQ502W6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VWA3BQ502W6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VWA3BQ502W6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VWA3BQ502W6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VWA3BQ502W6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VWA3BQ502W6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VWA3BQ502W6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VWA3BQ502W6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VWA3BQ502W6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VWA3BQ502W6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VWA3BQ502W6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VWA3BQ502W6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VWA3BQ502W6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VWA3BQ502W6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VWA3BQ502W6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
VWA3BQ502W6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VWA3BQ502W6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VWA3BQ502W6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VWA3BQ502W6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VWA3BQ502W6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VWA3BQ502W6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VWA3BQ502W6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VWA3BQ502W6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VWA3BQ502W6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VWA3BQ502W6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VWA3BQ502W6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VWA3BQ502W6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VWA3BQ502W6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VWA3BQ502W6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VWA3BQ502W6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VWA3BQ502W6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
VWA3BQ502W6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VWA3BQ502W6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VWA3BQ502W6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VWA3BQ502W6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VWA3BQ502W6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VWA3BQ502W6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
VWA3BQ502W6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VWA3BQ502W6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
VWA3BQ502W6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VWA3BQ502W6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
VWA3BQ502W6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VWA3BQ502W6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VWA3BQ502W6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VWA3BQ502W6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
VWA3BQ502W6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VWA3BQ502W6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
VWA3BQ502W6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VWA3BQ502W6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VWA3BQ502W6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VWA3BQ502W6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VWA3BQ502W6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VWA3BQ502W6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VWA3BQ502W6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VWA3BQ502W6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VWA3BQ502W6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VWA3BQ502W6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VWA3BQ502W6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VWA3BQ502W6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VWA3BQ502W6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VWA3BQ502W6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VWA3BQ502W6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VWA3BQ502W6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VWA3BQ502W6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VWA3BQ502W6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms