Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LONRF3Q496Y0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LONRF3Q496Y0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
LONRF3Q496Y0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LONRF3Q496Y0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LONRF3Q496Y0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LONRF3Q496Y0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LONRF3Q496Y0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LONRF3Q496Y0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LONRF3Q496Y0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LONRF3Q496Y0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LONRF3Q496Y0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LONRF3Q496Y0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LONRF3Q496Y0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LONRF3Q496Y0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LONRF3Q496Y0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LONRF3Q496Y0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LONRF3Q496Y0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LONRF3Q496Y0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LONRF3Q496Y0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LONRF3Q496Y0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
LONRF3Q496Y0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LONRF3Q496Y0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
LONRF3Q496Y0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LONRF3Q496Y0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LONRF3Q496Y0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LONRF3Q496Y0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
LONRF3Q496Y0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LONRF3Q496Y0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LONRF3Q496Y0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LONRF3Q496Y0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LONRF3Q496Y0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LONRF3Q496Y0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LONRF3Q496Y0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LONRF3Q496Y0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
LONRF3Q496Y0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LONRF3Q496Y0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LONRF3Q496Y0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LONRF3Q496Y0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LONRF3Q496Y0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LONRF3Q496Y0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LONRF3Q496Y0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LONRF3Q496Y0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LONRF3Q496Y0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LONRF3Q496Y0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LONRF3Q496Y0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LONRF3Q496Y0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LONRF3Q496Y0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LONRF3Q496Y0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LONRF3Q496Y0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LONRF3Q496Y0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LONRF3Q496Y0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LONRF3Q496Y0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LONRF3Q496Y0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LONRF3Q496Y0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LONRF3Q496Y0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LONRF3Q496Y0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LONRF3Q496Y0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LONRF3Q496Y0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LONRF3Q496Y0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LONRF3Q496Y0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LONRF3Q496Y0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LONRF3Q496Y0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LONRF3Q496Y0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LONRF3Q496Y0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LONRF3Q496Y0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LONRF3Q496Y0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LONRF3Q496Y0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LONRF3Q496Y0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LONRF3Q496Y0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LONRF3Q496Y0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LONRF3Q496Y0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LONRF3Q496Y0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LONRF3Q496Y0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LONRF3Q496Y0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LONRF3Q496Y0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LONRF3Q496Y0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LONRF3Q496Y0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LONRF3Q496Y0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LONRF3Q496Y0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LONRF3Q496Y0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LONRF3Q496Y0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LONRF3Q496Y0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LONRF3Q496Y0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LONRF3Q496Y0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LONRF3Q496Y0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LONRF3Q496Y0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LONRF3Q496Y0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LONRF3Q496Y0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LONRF3Q496Y0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LONRF3Q496Y0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LONRF3Q496Y0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LONRF3Q496Y0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LONRF3Q496Y0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LONRF3Q496Y0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LONRF3Q496Y0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LONRF3Q496Y0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LONRF3Q496Y0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LONRF3Q496Y0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LONRF3Q496Y0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.1 ms