Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCT1

ZNF260, Zinc finger protein 260, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF260Q3ZCT1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF260Q3ZCT1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF260Q3ZCT1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF260Q3ZCT1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF260Q3ZCT1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF260Q3ZCT1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF260Q3ZCT1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF260Q3ZCT1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF260Q3ZCT1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF260Q3ZCT1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF260Q3ZCT1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF260Q3ZCT1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF260Q3ZCT1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF260Q3ZCT1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF260Q3ZCT1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF260Q3ZCT1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF260Q3ZCT1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF260Q3ZCT1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF260Q3ZCT1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF260Q3ZCT1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF260Q3ZCT1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF260Q3ZCT1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF260Q3ZCT1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF260Q3ZCT1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF260Q3ZCT1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF260Q3ZCT1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF260Q3ZCT1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF260Q3ZCT1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF260Q3ZCT1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF260Q3ZCT1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF260Q3ZCT1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF260Q3ZCT1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF260Q3ZCT1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF260Q3ZCT1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF260Q3ZCT1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF260Q3ZCT1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF260Q3ZCT1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF260Q3ZCT1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF260Q3ZCT1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF260Q3ZCT1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF260Q3ZCT1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF260Q3ZCT1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF260Q3ZCT1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF260Q3ZCT1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF260Q3ZCT1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF260Q3ZCT1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF260Q3ZCT1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF260Q3ZCT1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF260Q3ZCT1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF260Q3ZCT1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF260Q3ZCT1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF260Q3ZCT1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF260Q3ZCT1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF260Q3ZCT1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF260Q3ZCT1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF260Q3ZCT1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF260Q3ZCT1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF260Q3ZCT1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF260Q3ZCT1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF260Q3ZCT1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF260Q3ZCT1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF260Q3ZCT1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF260Q3ZCT1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF260Q3ZCT1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF260Q3ZCT1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF260Q3ZCT1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF260Q3ZCT1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF260Q3ZCT1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF260Q3ZCT1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF260Q3ZCT1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF260Q3ZCT1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF260Q3ZCT1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF260Q3ZCT1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF260Q3ZCT1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF260Q3ZCT1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF260Q3ZCT1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF260Q3ZCT1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF260Q3ZCT1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF260Q3ZCT1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF260Q3ZCT1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF260Q3ZCT1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF260Q3ZCT1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF260Q3ZCT1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF260Q3ZCT1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF260Q3ZCT1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF260Q3ZCT1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF260Q3ZCT1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF260Q3ZCT1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF260Q3ZCT1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF260Q3ZCT1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF260Q3ZCT1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF260Q3ZCT1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF260Q3ZCT1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF260Q3ZCT1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF260Q3ZCT1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF260Q3ZCT1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF260Q3ZCT1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF260Q3ZCT1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF260Q3ZCT1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF260Q3ZCT1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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