Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL9Q3SXZ7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL9Q3SXZ7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL9Q3SXZ7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL9Q3SXZ7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL9Q3SXZ7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL9Q3SXZ7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL9Q3SXZ7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL9Q3SXZ7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTLL9Q3SXZ7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTLL9Q3SXZ7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTLL9Q3SXZ7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TTLL9Q3SXZ7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTLL9Q3SXZ7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTLL9Q3SXZ7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTLL9Q3SXZ7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLL9Q3SXZ7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLL9Q3SXZ7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLL9Q3SXZ7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLL9Q3SXZ7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLL9Q3SXZ7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTLL9Q3SXZ7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTLL9Q3SXZ7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTLL9Q3SXZ7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TTLL9Q3SXZ7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTLL9Q3SXZ7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTLL9Q3SXZ7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTLL9Q3SXZ7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLL9Q3SXZ7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLL9Q3SXZ7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLL9Q3SXZ7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLL9Q3SXZ7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTLL9Q3SXZ7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTLL9Q3SXZ7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTLL9Q3SXZ7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTLL9Q3SXZ7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTLL9Q3SXZ7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TTLL9Q3SXZ7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TTLL9Q3SXZ7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTLL9Q3SXZ7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTLL9Q3SXZ7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTLL9Q3SXZ7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTLL9Q3SXZ7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL9Q3SXZ7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL9Q3SXZ7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL9Q3SXZ7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL9Q3SXZ7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL9Q3SXZ7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL9Q3SXZ7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL9Q3SXZ7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL9Q3SXZ7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL9Q3SXZ7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL9Q3SXZ7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL9Q3SXZ7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL9Q3SXZ7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL9Q3SXZ7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL9Q3SXZ7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL9Q3SXZ7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL9Q3SXZ7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL9Q3SXZ7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTLL9Q3SXZ7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TTLL9Q3SXZ7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TTLL9Q3SXZ7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TTLL9Q3SXZ7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL9Q3SXZ7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL9Q3SXZ7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL9Q3SXZ7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTLL9Q3SXZ7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL9Q3SXZ7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTLL9Q3SXZ7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL9Q3SXZ7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL9Q3SXZ7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTLL9Q3SXZ7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL9Q3SXZ7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL9Q3SXZ7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL9Q3SXZ7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL9Q3SXZ7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL9Q3SXZ7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL9Q3SXZ7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL9Q3SXZ7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL9Q3SXZ7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL9Q3SXZ7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL9Q3SXZ7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL9Q3SXZ7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL9Q3SXZ7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL9Q3SXZ7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL9Q3SXZ7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTLL9Q3SXZ7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL9Q3SXZ7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL9Q3SXZ7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL9Q3SXZ7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL9Q3SXZ7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL9Q3SXZ7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTLL9Q3SXZ7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL9Q3SXZ7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL9Q3SXZ7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL9Q3SXZ7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL9Q3SXZ7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL9Q3SXZ7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL9Q3SXZ7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms