Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL38Q2WGJ6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL38Q2WGJ6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL38Q2WGJ6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL38Q2WGJ6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL38Q2WGJ6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL38Q2WGJ6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL38Q2WGJ6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL38Q2WGJ6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KLHL38Q2WGJ6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KLHL38Q2WGJ6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL38Q2WGJ6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL38Q2WGJ6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL38Q2WGJ6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL38Q2WGJ6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL38Q2WGJ6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL38Q2WGJ6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL38Q2WGJ6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL38Q2WGJ6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL38Q2WGJ6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL38Q2WGJ6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL38Q2WGJ6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL38Q2WGJ6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL38Q2WGJ6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL38Q2WGJ6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL38Q2WGJ6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL38Q2WGJ6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL38Q2WGJ6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL38Q2WGJ6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL38Q2WGJ6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL38Q2WGJ6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL38Q2WGJ6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL38Q2WGJ6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL38Q2WGJ6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL38Q2WGJ6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL38Q2WGJ6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL38Q2WGJ6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL38Q2WGJ6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL38Q2WGJ6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL38Q2WGJ6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL38Q2WGJ6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL38Q2WGJ6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL38Q2WGJ6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL38Q2WGJ6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL38Q2WGJ6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL38Q2WGJ6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KLHL38Q2WGJ6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms