Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KNOP1Q1ED39 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KNOP1Q1ED39 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KNOP1Q1ED39 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KNOP1Q1ED39 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KNOP1Q1ED39 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KNOP1Q1ED39 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KNOP1Q1ED39 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
KNOP1Q1ED39 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KNOP1Q1ED39 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KNOP1Q1ED39 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KNOP1Q1ED39 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KNOP1Q1ED39 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KNOP1Q1ED39 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
KNOP1Q1ED39 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KNOP1Q1ED39 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
KNOP1Q1ED39 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KNOP1Q1ED39 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KNOP1Q1ED39 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KNOP1Q1ED39 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KNOP1Q1ED39 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KNOP1Q1ED39 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KNOP1Q1ED39 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KNOP1Q1ED39 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KNOP1Q1ED39 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KNOP1Q1ED39 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KNOP1Q1ED39 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KNOP1Q1ED39 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KNOP1Q1ED39 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KNOP1Q1ED39 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KNOP1Q1ED39 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KNOP1Q1ED39 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KNOP1Q1ED39 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KNOP1Q1ED39 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KNOP1Q1ED39 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KNOP1Q1ED39 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KNOP1Q1ED39 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KNOP1Q1ED39 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KNOP1Q1ED39 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KNOP1Q1ED39 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
KNOP1Q1ED39 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KNOP1Q1ED39 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KNOP1Q1ED39 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
KNOP1Q1ED39 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
KNOP1Q1ED39 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KNOP1Q1ED39 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KNOP1Q1ED39 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KNOP1Q1ED39 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KNOP1Q1ED39 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KNOP1Q1ED39 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KNOP1Q1ED39 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KNOP1Q1ED39 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KNOP1Q1ED39 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KNOP1Q1ED39 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KNOP1Q1ED39 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KNOP1Q1ED39 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KNOP1Q1ED39 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
KNOP1Q1ED39 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KNOP1Q1ED39 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KNOP1Q1ED39 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KNOP1Q1ED39 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KNOP1Q1ED39 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KNOP1Q1ED39 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KNOP1Q1ED39 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
KNOP1Q1ED39 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KNOP1Q1ED39 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KNOP1Q1ED39 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KNOP1Q1ED39 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KNOP1Q1ED39 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
KNOP1Q1ED39 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KNOP1Q1ED39 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
KNOP1Q1ED39 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KNOP1Q1ED39 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KNOP1Q1ED39 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KNOP1Q1ED39 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KNOP1Q1ED39 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KNOP1Q1ED39 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KNOP1Q1ED39 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KNOP1Q1ED39 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KNOP1Q1ED39 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KNOP1Q1ED39 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KNOP1Q1ED39 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KNOP1Q1ED39 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
KNOP1Q1ED39 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KNOP1Q1ED39 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KNOP1Q1ED39 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KNOP1Q1ED39 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KNOP1Q1ED39 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KNOP1Q1ED39 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KNOP1Q1ED39 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KNOP1Q1ED39 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KNOP1Q1ED39 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KNOP1Q1ED39 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KNOP1Q1ED39 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KNOP1Q1ED39 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KNOP1Q1ED39 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KNOP1Q1ED39 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KNOP1Q1ED39 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KNOP1Q1ED39 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KNOP1Q1ED39 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms