Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP1R3AQ16821 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP1R3AQ16821 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP1R3AQ16821 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP1R3AQ16821 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP1R3AQ16821 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP1R3AQ16821 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP1R3AQ16821 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP1R3AQ16821 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP1R3AQ16821 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP1R3AQ16821 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP1R3AQ16821 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP1R3AQ16821 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPP1R3AQ16821 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PPP1R3AQ16821 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPP1R3AQ16821 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPP1R3AQ16821 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP1R3AQ16821 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP1R3AQ16821 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP1R3AQ16821 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP1R3AQ16821 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP1R3AQ16821 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP1R3AQ16821 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP1R3AQ16821 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP1R3AQ16821 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP1R3AQ16821 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP1R3AQ16821 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP1R3AQ16821 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PPP1R3AQ16821 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPP1R3AQ16821 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPP1R3AQ16821 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPP1R3AQ16821 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP1R3AQ16821 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP1R3AQ16821 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP1R3AQ16821 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP1R3AQ16821 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R3AQ16821 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R3AQ16821 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R3AQ16821 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R3AQ16821 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R3AQ16821 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP1R3AQ16821 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP1R3AQ16821 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP1R3AQ16821 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP1R3AQ16821 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PPP1R3AQ16821 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R3AQ16821 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R3AQ16821 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R3AQ16821 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R3AQ16821 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R3AQ16821 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R3AQ16821 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R3AQ16821 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R3AQ16821 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP1R3AQ16821 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP1R3AQ16821 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP1R3AQ16821 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP1R3AQ16821 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP1R3AQ16821 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP1R3AQ16821 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP1R3AQ16821 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP1R3AQ16821 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP1R3AQ16821 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP1R3AQ16821 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP1R3AQ16821 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP1R3AQ16821 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP1R3AQ16821 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPP1R3AQ16821 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPP1R3AQ16821 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPP1R3AQ16821 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPP1R3AQ16821 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPP1R3AQ16821 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP1R3AQ16821 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP1R3AQ16821 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP1R3AQ16821 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP1R3AQ16821 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP1R3AQ16821 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP1R3AQ16821 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP1R3AQ16821 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP1R3AQ16821 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP1R3AQ16821 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP1R3AQ16821 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP1R3AQ16821 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP1R3AQ16821 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP1R3AQ16821 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP1R3AQ16821 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP1R3AQ16821 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPP1R3AQ16821 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPP1R3AQ16821 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPP1R3AQ16821 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PPP1R3AQ16821 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PPP1R3AQ16821 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPP1R3AQ16821 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPP1R3AQ16821 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPP1R3AQ16821 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPP1R3AQ16821 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPP1R3AQ16821 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPP1R3AQ16821 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP1R3AQ16821 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP1R3AQ16821 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
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