Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HIST3H3Q16695 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIST3H3Q16695 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HIST3H3Q16695 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIST3H3Q16695 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIST3H3Q16695 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HIST3H3Q16695 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HIST3H3Q16695 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HIST3H3Q16695 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HIST3H3Q16695 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HIST3H3Q16695 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HIST3H3Q16695 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIST3H3Q16695 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HIST3H3Q16695 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HIST3H3Q16695 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HIST3H3Q16695 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIST3H3Q16695 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIST3H3Q16695 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HIST3H3Q16695 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIST3H3Q16695 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIST3H3Q16695 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIST3H3Q16695 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIST3H3Q16695 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIST3H3Q16695 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIST3H3Q16695 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIST3H3Q16695 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIST3H3Q16695 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIST3H3Q16695 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIST3H3Q16695 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIST3H3Q16695 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIST3H3Q16695 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIST3H3Q16695 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIST3H3Q16695 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIST3H3Q16695 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIST3H3Q16695 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIST3H3Q16695 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIST3H3Q16695 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIST3H3Q16695 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIST3H3Q16695 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIST3H3Q16695 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIST3H3Q16695 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIST3H3Q16695 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIST3H3Q16695 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIST3H3Q16695 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIST3H3Q16695 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HIST3H3Q16695 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIST3H3Q16695 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIST3H3Q16695 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIST3H3Q16695 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIST3H3Q16695 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIST3H3Q16695 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIST3H3Q16695 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIST3H3Q16695 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HIST3H3Q16695 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIST3H3Q16695 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIST3H3Q16695 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HIST3H3Q16695 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIST3H3Q16695 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIST3H3Q16695 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIST3H3Q16695 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIST3H3Q16695 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIST3H3Q16695 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HIST3H3Q16695 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIST3H3Q16695 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIST3H3Q16695 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIST3H3Q16695 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIST3H3Q16695 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIST3H3Q16695 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIST3H3Q16695 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIST3H3Q16695 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIST3H3Q16695 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIST3H3Q16695 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIST3H3Q16695 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIST3H3Q16695 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HIST3H3Q16695 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIST3H3Q16695 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIST3H3Q16695 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIST3H3Q16695 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIST3H3Q16695 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIST3H3Q16695 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIST3H3Q16695 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIST3H3Q16695 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIST3H3Q16695 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIST3H3Q16695 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIST3H3Q16695 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIST3H3Q16695 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIST3H3Q16695 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIST3H3Q16695 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIST3H3Q16695 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIST3H3Q16695 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIST3H3Q16695 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIST3H3Q16695 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIST3H3Q16695 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIST3H3Q16695 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HIST3H3Q16695 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIST3H3Q16695 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIST3H3Q16695 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIST3H3Q16695 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIST3H3Q16695 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIST3H3Q16695 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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