Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
STX1AQ16623 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
STX1AQ16623 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
STX1AQ16623 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
STX1AQ16623 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
STX1AQ16623 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
STX1AQ16623 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
STX1AQ16623 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
STX1AQ16623 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
STX1AQ16623 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
STX1AQ16623 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
STX1AQ16623 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
STX1AQ16623 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
STX1AQ16623 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
STX1AQ16623 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
STX1AQ16623 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
STX1AQ16623 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
STX1AQ16623 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
STX1AQ16623 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
STX1AQ16623 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
STX1AQ16623 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
STX1AQ16623 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
STX1AQ16623 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
STX1AQ16623 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
STX1AQ16623 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
STX1AQ16623 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
STX1AQ16623 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
STX1AQ16623 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
STX1AQ16623 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
STX1AQ16623 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
STX1AQ16623 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
STX1AQ16623 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
STX1AQ16623 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
STX1AQ16623 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
STX1AQ16623 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
STX1AQ16623 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
STX1AQ16623 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
STX1AQ16623 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
STX1AQ16623 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
STX1AQ16623 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
STX1AQ16623 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STX1AQ16623 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STX1AQ16623 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
STX1AQ16623 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
STX1AQ16623 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
STX1AQ16623 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STX1AQ16623 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STX1AQ16623 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STX1AQ16623 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STX1AQ16623 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
STX1AQ16623 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STX1AQ16623 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STX1AQ16623 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STX1AQ16623 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
STX1AQ16623 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STX1AQ16623 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STX1AQ16623 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STX1AQ16623 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STX1AQ16623 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
STX1AQ16623 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
STX1AQ16623 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
STX1AQ16623 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STX1AQ16623 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STX1AQ16623 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
STX1AQ16623 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STX1AQ16623 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
STX1AQ16623 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STX1AQ16623 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
STX1AQ16623 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
STX1AQ16623 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
STX1AQ16623 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
STX1AQ16623 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STX1AQ16623 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
STX1AQ16623 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STX1AQ16623 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STX1AQ16623 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
STX1AQ16623 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STX1AQ16623 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STX1AQ16623 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STX1AQ16623 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STX1AQ16623 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STX1AQ16623 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STX1AQ16623 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
STX1AQ16623 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
STX1AQ16623 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
STX1AQ16623 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
STX1AQ16623 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
STX1AQ16623 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
STX1AQ16623 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
STX1AQ16623 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
STX1AQ16623 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
STX1AQ16623 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STX1AQ16623 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STX1AQ16623 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STX1AQ16623 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
STX1AQ16623 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STX1AQ16623 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
STX1AQ16623 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
STX1AQ16623 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STX1AQ16623 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
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