Protein–RNA interactions for Protein: Q16515

ASIC2, Acid-sensing ion channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC2Q16515 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ASIC2Q16515 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ASIC2Q16515 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ASIC2Q16515 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ASIC2Q16515 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ASIC2Q16515 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ASIC2Q16515 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ASIC2Q16515 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ASIC2Q16515 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ASIC2Q16515 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ASIC2Q16515 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ASIC2Q16515 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ASIC2Q16515 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ASIC2Q16515 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ASIC2Q16515 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ASIC2Q16515 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ASIC2Q16515 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ASIC2Q16515 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ASIC2Q16515 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ASIC2Q16515 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ASIC2Q16515 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ASIC2Q16515 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ASIC2Q16515 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ASIC2Q16515 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ASIC2Q16515 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ASIC2Q16515 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ASIC2Q16515 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ASIC2Q16515 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ASIC2Q16515 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ASIC2Q16515 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ASIC2Q16515 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ASIC2Q16515 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ASIC2Q16515 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ASIC2Q16515 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ASIC2Q16515 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ASIC2Q16515 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ASIC2Q16515 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ASIC2Q16515 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ASIC2Q16515 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ASIC2Q16515 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ASIC2Q16515 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ASIC2Q16515 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ASIC2Q16515 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ASIC2Q16515 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ASIC2Q16515 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ASIC2Q16515 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ASIC2Q16515 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ASIC2Q16515 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ASIC2Q16515 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ASIC2Q16515 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ASIC2Q16515 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ASIC2Q16515 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ASIC2Q16515 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ASIC2Q16515 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ASIC2Q16515 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ASIC2Q16515 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ASIC2Q16515 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ASIC2Q16515 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ASIC2Q16515 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ASIC2Q16515 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ASIC2Q16515 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ASIC2Q16515 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ASIC2Q16515 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ASIC2Q16515 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ASIC2Q16515 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ASIC2Q16515 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ASIC2Q16515 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ASIC2Q16515 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ASIC2Q16515 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ASIC2Q16515 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ASIC2Q16515 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ASIC2Q16515 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ASIC2Q16515 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ASIC2Q16515 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ASIC2Q16515 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ASIC2Q16515 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ASIC2Q16515 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ASIC2Q16515 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ASIC2Q16515 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ASIC2Q16515 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ASIC2Q16515 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ASIC2Q16515 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ASIC2Q16515 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ASIC2Q16515 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ASIC2Q16515 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ASIC2Q16515 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ASIC2Q16515 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ASIC2Q16515 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ASIC2Q16515 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ASIC2Q16515 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ASIC2Q16515 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ASIC2Q16515 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ASIC2Q16515 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ASIC2Q16515 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ASIC2Q16515 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ASIC2Q16515 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ASIC2Q16515 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ASIC2Q16515 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ASIC2Q16515 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ASIC2Q16515 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms