Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NTRK3Q16288 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NTRK3Q16288 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NTRK3Q16288 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NTRK3Q16288 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NTRK3Q16288 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NTRK3Q16288 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NTRK3Q16288 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NTRK3Q16288 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NTRK3Q16288 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NTRK3Q16288 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NTRK3Q16288 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NTRK3Q16288 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NTRK3Q16288 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NTRK3Q16288 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NTRK3Q16288 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NTRK3Q16288 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NTRK3Q16288 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NTRK3Q16288 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NTRK3Q16288 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NTRK3Q16288 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NTRK3Q16288 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NTRK3Q16288 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NTRK3Q16288 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NTRK3Q16288 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NTRK3Q16288 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NTRK3Q16288 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NTRK3Q16288 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NTRK3Q16288 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NTRK3Q16288 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NTRK3Q16288 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NTRK3Q16288 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NTRK3Q16288 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NTRK3Q16288 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NTRK3Q16288 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NTRK3Q16288 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NTRK3Q16288 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NTRK3Q16288 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NTRK3Q16288 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NTRK3Q16288 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NTRK3Q16288 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
NTRK3Q16288 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NTRK3Q16288 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NTRK3Q16288 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NTRK3Q16288 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NTRK3Q16288 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NTRK3Q16288 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NTRK3Q16288 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NTRK3Q16288 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NTRK3Q16288 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NTRK3Q16288 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NTRK3Q16288 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NTRK3Q16288 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NTRK3Q16288 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NTRK3Q16288 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NTRK3Q16288 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NTRK3Q16288 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NTRK3Q16288 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NTRK3Q16288 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NTRK3Q16288 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NTRK3Q16288 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NTRK3Q16288 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NTRK3Q16288 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NTRK3Q16288 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NTRK3Q16288 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NTRK3Q16288 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NTRK3Q16288 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NTRK3Q16288 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NTRK3Q16288 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NTRK3Q16288 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NTRK3Q16288 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NTRK3Q16288 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NTRK3Q16288 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NTRK3Q16288 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NTRK3Q16288 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NTRK3Q16288 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NTRK3Q16288 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NTRK3Q16288 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NTRK3Q16288 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NTRK3Q16288 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NTRK3Q16288 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NTRK3Q16288 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NTRK3Q16288 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NTRK3Q16288 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NTRK3Q16288 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NTRK3Q16288 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NTRK3Q16288 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NTRK3Q16288 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NTRK3Q16288 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NTRK3Q16288 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NTRK3Q16288 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NTRK3Q16288 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NTRK3Q16288 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NTRK3Q16288 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NTRK3Q16288 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NTRK3Q16288 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NTRK3Q16288 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NTRK3Q16288 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NTRK3Q16288 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NTRK3Q16288 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms