Protein–RNA interactions for Protein: Q15599

SLC9A3R2, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3R2Q15599 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC9A3R2Q15599 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC9A3R2Q15599 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC9A3R2Q15599 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC9A3R2Q15599 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC9A3R2Q15599 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC9A3R2Q15599 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC9A3R2Q15599 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC9A3R2Q15599 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC9A3R2Q15599 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC9A3R2Q15599 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC9A3R2Q15599 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC9A3R2Q15599 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC9A3R2Q15599 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC9A3R2Q15599 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC9A3R2Q15599 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC9A3R2Q15599 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC9A3R2Q15599 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC9A3R2Q15599 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC9A3R2Q15599 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC9A3R2Q15599 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC9A3R2Q15599 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC9A3R2Q15599 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC9A3R2Q15599 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC9A3R2Q15599 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC9A3R2Q15599 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC9A3R2Q15599 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC9A3R2Q15599 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC9A3R2Q15599 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC9A3R2Q15599 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC9A3R2Q15599 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC9A3R2Q15599 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC9A3R2Q15599 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC9A3R2Q15599 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC9A3R2Q15599 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC9A3R2Q15599 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC9A3R2Q15599 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC9A3R2Q15599 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC9A3R2Q15599 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC9A3R2Q15599 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC9A3R2Q15599 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC9A3R2Q15599 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC9A3R2Q15599 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC9A3R2Q15599 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC9A3R2Q15599 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A3R2Q15599 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A3R2Q15599 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A3R2Q15599 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A3R2Q15599 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A3R2Q15599 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A3R2Q15599 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A3R2Q15599 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A3R2Q15599 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A3R2Q15599 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A3R2Q15599 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A3R2Q15599 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A3R2Q15599 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A3R2Q15599 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A3R2Q15599 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A3R2Q15599 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A3R2Q15599 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A3R2Q15599 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A3R2Q15599 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A3R2Q15599 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A3R2Q15599 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A3R2Q15599 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A3R2Q15599 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A3R2Q15599 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A3R2Q15599 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A3R2Q15599 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A3R2Q15599 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A3R2Q15599 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC9A3R2Q15599 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC9A3R2Q15599 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC9A3R2Q15599 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC9A3R2Q15599 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC9A3R2Q15599 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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