Protein–RNA interactions for Protein: Q15428

SF3A2, Splicing factor 3A subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A2Q15428 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SF3A2Q15428 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SF3A2Q15428 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SF3A2Q15428 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SF3A2Q15428 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SF3A2Q15428 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SF3A2Q15428 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SF3A2Q15428 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SF3A2Q15428 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SF3A2Q15428 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SF3A2Q15428 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SF3A2Q15428 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SF3A2Q15428 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SF3A2Q15428 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SF3A2Q15428 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SF3A2Q15428 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SF3A2Q15428 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SF3A2Q15428 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SF3A2Q15428 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SF3A2Q15428 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SF3A2Q15428 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SF3A2Q15428 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SF3A2Q15428 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SF3A2Q15428 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SF3A2Q15428 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SF3A2Q15428 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SF3A2Q15428 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SF3A2Q15428 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SF3A2Q15428 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SF3A2Q15428 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SF3A2Q15428 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SF3A2Q15428 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SF3A2Q15428 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SF3A2Q15428 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SF3A2Q15428 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SF3A2Q15428 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SF3A2Q15428 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SF3A2Q15428 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SF3A2Q15428 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SF3A2Q15428 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SF3A2Q15428 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SF3A2Q15428 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SF3A2Q15428 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SF3A2Q15428 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SF3A2Q15428 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SF3A2Q15428 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SF3A2Q15428 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SF3A2Q15428 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SF3A2Q15428 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SF3A2Q15428 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SF3A2Q15428 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SF3A2Q15428 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SF3A2Q15428 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SF3A2Q15428 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SF3A2Q15428 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SF3A2Q15428 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SF3A2Q15428 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SF3A2Q15428 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SF3A2Q15428 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SF3A2Q15428 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SF3A2Q15428 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SF3A2Q15428 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SF3A2Q15428 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SF3A2Q15428 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SF3A2Q15428 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SF3A2Q15428 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SF3A2Q15428 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SF3A2Q15428 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SF3A2Q15428 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SF3A2Q15428 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SF3A2Q15428 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SF3A2Q15428 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SF3A2Q15428 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SF3A2Q15428 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SF3A2Q15428 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SF3A2Q15428 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SF3A2Q15428 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SF3A2Q15428 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SF3A2Q15428 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SF3A2Q15428 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SF3A2Q15428 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SF3A2Q15428 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SF3A2Q15428 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SF3A2Q15428 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SF3A2Q15428 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SF3A2Q15428 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SF3A2Q15428 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SF3A2Q15428 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SF3A2Q15428 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SF3A2Q15428 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SF3A2Q15428 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SF3A2Q15428 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SF3A2Q15428 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SF3A2Q15428 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SF3A2Q15428 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SF3A2Q15428 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SF3A2Q15428 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SF3A2Q15428 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SF3A2Q15428 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SF3A2Q15428 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
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