Protein–RNA interactions for Protein: Q15287

RNPS1, RNA-binding protein with serine-rich domain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1Q15287 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNPS1Q15287 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNPS1Q15287 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNPS1Q15287 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RNPS1Q15287 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNPS1Q15287 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNPS1Q15287 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNPS1Q15287 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNPS1Q15287 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNPS1Q15287 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNPS1Q15287 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNPS1Q15287 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNPS1Q15287 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNPS1Q15287 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNPS1Q15287 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNPS1Q15287 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNPS1Q15287 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNPS1Q15287 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNPS1Q15287 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNPS1Q15287 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNPS1Q15287 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNPS1Q15287 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNPS1Q15287 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNPS1Q15287 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNPS1Q15287 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNPS1Q15287 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNPS1Q15287 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNPS1Q15287 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNPS1Q15287 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNPS1Q15287 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNPS1Q15287 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RNPS1Q15287 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RNPS1Q15287 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNPS1Q15287 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNPS1Q15287 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNPS1Q15287 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNPS1Q15287 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNPS1Q15287 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNPS1Q15287 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNPS1Q15287 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNPS1Q15287 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNPS1Q15287 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNPS1Q15287 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNPS1Q15287 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNPS1Q15287 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNPS1Q15287 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNPS1Q15287 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNPS1Q15287 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNPS1Q15287 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNPS1Q15287 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNPS1Q15287 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNPS1Q15287 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNPS1Q15287 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNPS1Q15287 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNPS1Q15287 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNPS1Q15287 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNPS1Q15287 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNPS1Q15287 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RNPS1Q15287 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNPS1Q15287 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNPS1Q15287 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RNPS1Q15287 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RNPS1Q15287 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNPS1Q15287 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNPS1Q15287 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RNPS1Q15287 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RNPS1Q15287 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RNPS1Q15287 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RNPS1Q15287 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNPS1Q15287 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNPS1Q15287 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RNPS1Q15287 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNPS1Q15287 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RNPS1Q15287 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNPS1Q15287 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNPS1Q15287 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RNPS1Q15287 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
RNPS1Q15287 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RNPS1Q15287 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNPS1Q15287 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNPS1Q15287 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNPS1Q15287 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNPS1Q15287 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNPS1Q15287 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RNPS1Q15287 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNPS1Q15287 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNPS1Q15287 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNPS1Q15287 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RNPS1Q15287 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNPS1Q15287 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNPS1Q15287 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNPS1Q15287 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNPS1Q15287 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RNPS1Q15287 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNPS1Q15287 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RNPS1Q15287 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RNPS1Q15287 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNPS1Q15287 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RNPS1Q15287 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RNPS1Q15287 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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