Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCD1Q15116 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCD1Q15116 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCD1Q15116 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCD1Q15116 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PDCD1Q15116 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PDCD1Q15116 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDCD1Q15116 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDCD1Q15116 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDCD1Q15116 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDCD1Q15116 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDCD1Q15116 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDCD1Q15116 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDCD1Q15116 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDCD1Q15116 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PDCD1Q15116 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDCD1Q15116 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDCD1Q15116 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDCD1Q15116 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDCD1Q15116 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDCD1Q15116 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PDCD1Q15116 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDCD1Q15116 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDCD1Q15116 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDCD1Q15116 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDCD1Q15116 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDCD1Q15116 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDCD1Q15116 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDCD1Q15116 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDCD1Q15116 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDCD1Q15116 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDCD1Q15116 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDCD1Q15116 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDCD1Q15116 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDCD1Q15116 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDCD1Q15116 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PDCD1Q15116 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PDCD1Q15116 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDCD1Q15116 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDCD1Q15116 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDCD1Q15116 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDCD1Q15116 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDCD1Q15116 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDCD1Q15116 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDCD1Q15116 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDCD1Q15116 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDCD1Q15116 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDCD1Q15116 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDCD1Q15116 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDCD1Q15116 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDCD1Q15116 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDCD1Q15116 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDCD1Q15116 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDCD1Q15116 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDCD1Q15116 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDCD1Q15116 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDCD1Q15116 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDCD1Q15116 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDCD1Q15116 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDCD1Q15116 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDCD1Q15116 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDCD1Q15116 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDCD1Q15116 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDCD1Q15116 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDCD1Q15116 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDCD1Q15116 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDCD1Q15116 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDCD1Q15116 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDCD1Q15116 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDCD1Q15116 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDCD1Q15116 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDCD1Q15116 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDCD1Q15116 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDCD1Q15116 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDCD1Q15116 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDCD1Q15116 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDCD1Q15116 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDCD1Q15116 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDCD1Q15116 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDCD1Q15116 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDCD1Q15116 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDCD1Q15116 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDCD1Q15116 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDCD1Q15116 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDCD1Q15116 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDCD1Q15116 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDCD1Q15116 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDCD1Q15116 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDCD1Q15116 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDCD1Q15116 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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