Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERC3Q15034 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERC3Q15034 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HERC3Q15034 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERC3Q15034 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERC3Q15034 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERC3Q15034 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERC3Q15034 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERC3Q15034 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERC3Q15034 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERC3Q15034 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERC3Q15034 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERC3Q15034 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERC3Q15034 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERC3Q15034 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERC3Q15034 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERC3Q15034 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERC3Q15034 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERC3Q15034 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERC3Q15034 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERC3Q15034 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERC3Q15034 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERC3Q15034 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERC3Q15034 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERC3Q15034 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERC3Q15034 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERC3Q15034 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERC3Q15034 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HERC3Q15034 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERC3Q15034 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERC3Q15034 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERC3Q15034 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERC3Q15034 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERC3Q15034 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERC3Q15034 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERC3Q15034 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERC3Q15034 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERC3Q15034 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERC3Q15034 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERC3Q15034 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HERC3Q15034 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERC3Q15034 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERC3Q15034 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HERC3Q15034 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERC3Q15034 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC3Q15034 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC3Q15034 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC3Q15034 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC3Q15034 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC3Q15034 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC3Q15034 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC3Q15034 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC3Q15034 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERC3Q15034 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HERC3Q15034 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERC3Q15034 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HERC3Q15034 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERC3Q15034 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERC3Q15034 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERC3Q15034 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERC3Q15034 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERC3Q15034 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERC3Q15034 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERC3Q15034 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERC3Q15034 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERC3Q15034 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERC3Q15034 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERC3Q15034 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERC3Q15034 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERC3Q15034 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERC3Q15034 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERC3Q15034 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERC3Q15034 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERC3Q15034 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERC3Q15034 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERC3Q15034 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERC3Q15034 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERC3Q15034 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERC3Q15034 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERC3Q15034 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERC3Q15034 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERC3Q15034 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERC3Q15034 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HERC3Q15034 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HERC3Q15034 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HERC3Q15034 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HERC3Q15034 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERC3Q15034 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERC3Q15034 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERC3Q15034 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERC3Q15034 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERC3Q15034 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERC3Q15034 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERC3Q15034 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HERC3Q15034 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERC3Q15034 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERC3Q15034 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERC3Q15034 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERC3Q15034 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERC3Q15034 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
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