Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPSQ13938 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPSQ13938 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPSQ13938 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPSQ13938 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPSQ13938 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPSQ13938 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPSQ13938 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAPSQ13938 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CAPSQ13938 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAPSQ13938 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPSQ13938 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPSQ13938 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPSQ13938 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPSQ13938 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPSQ13938 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPSQ13938 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPSQ13938 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPSQ13938 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPSQ13938 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAPSQ13938 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAPSQ13938 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAPSQ13938 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAPSQ13938 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAPSQ13938 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAPSQ13938 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAPSQ13938 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAPSQ13938 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAPSQ13938 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAPSQ13938 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPSQ13938 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPSQ13938 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPSQ13938 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPSQ13938 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPSQ13938 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAPSQ13938 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAPSQ13938 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAPSQ13938 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAPSQ13938 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAPSQ13938 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CAPSQ13938 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CAPSQ13938 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CAPSQ13938 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CAPSQ13938 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CAPSQ13938 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CAPSQ13938 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAPSQ13938 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CAPSQ13938 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAPSQ13938 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPSQ13938 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPSQ13938 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPSQ13938 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPSQ13938 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPSQ13938 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPSQ13938 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPSQ13938 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPSQ13938 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPSQ13938 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPSQ13938 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPSQ13938 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPSQ13938 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPSQ13938 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPSQ13938 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPSQ13938 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPSQ13938 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPSQ13938 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPSQ13938 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPSQ13938 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPSQ13938 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPSQ13938 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPSQ13938 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPSQ13938 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPSQ13938 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPSQ13938 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPSQ13938 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPSQ13938 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPSQ13938 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAPSQ13938 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAPSQ13938 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAPSQ13938 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAPSQ13938 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAPSQ13938 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAPSQ13938 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAPSQ13938 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAPSQ13938 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CAPSQ13938 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CAPSQ13938 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CAPSQ13938 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CAPSQ13938 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CAPSQ13938 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPSQ13938 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPSQ13938 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPSQ13938 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPSQ13938 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPSQ13938 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPSQ13938 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPSQ13938 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPSQ13938 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAPSQ13938 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAPSQ13938 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
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