Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP1A4Q13733 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP1A4Q13733 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP1A4Q13733 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP1A4Q13733 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP1A4Q13733 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP1A4Q13733 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP1A4Q13733 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP1A4Q13733 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP1A4Q13733 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP1A4Q13733 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP1A4Q13733 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP1A4Q13733 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP1A4Q13733 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP1A4Q13733 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP1A4Q13733 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP1A4Q13733 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP1A4Q13733 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP1A4Q13733 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP1A4Q13733 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP1A4Q13733 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP1A4Q13733 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP1A4Q13733 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP1A4Q13733 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP1A4Q13733 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP1A4Q13733 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP1A4Q13733 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP1A4Q13733 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP1A4Q13733 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP1A4Q13733 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP1A4Q13733 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP1A4Q13733 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP1A4Q13733 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP1A4Q13733 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP1A4Q13733 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP1A4Q13733 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP1A4Q13733 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP1A4Q13733 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP1A4Q13733 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP1A4Q13733 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP1A4Q13733 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP1A4Q13733 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP1A4Q13733 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP1A4Q13733 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP1A4Q13733 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP1A4Q13733 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP1A4Q13733 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP1A4Q13733 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP1A4Q13733 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP1A4Q13733 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP1A4Q13733 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP1A4Q13733 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP1A4Q13733 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP1A4Q13733 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP1A4Q13733 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP1A4Q13733 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP1A4Q13733 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP1A4Q13733 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP1A4Q13733 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP1A4Q13733 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP1A4Q13733 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP1A4Q13733 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP1A4Q13733 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP1A4Q13733 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP1A4Q13733 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP1A4Q13733 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP1A4Q13733 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP1A4Q13733 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP1A4Q13733 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP1A4Q13733 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP1A4Q13733 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP1A4Q13733 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP1A4Q13733 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP1A4Q13733 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP1A4Q13733 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP1A4Q13733 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP1A4Q13733 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP1A4Q13733 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP1A4Q13733 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP1A4Q13733 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP1A4Q13733 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
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