Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4Q12950 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4Q12950 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXD4Q12950 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD4Q12950 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD4Q12950 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD4Q12950 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD4Q12950 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXD4Q12950 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4Q12950 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4Q12950 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4Q12950 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4Q12950 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4Q12950 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4Q12950 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4Q12950 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXD4Q12950 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4Q12950 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4Q12950 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXD4Q12950 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXD4Q12950 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOXD4Q12950 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4Q12950 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4Q12950 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4Q12950 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXD4Q12950 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4Q12950 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4Q12950 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4Q12950 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4Q12950 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4Q12950 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4Q12950 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXD4Q12950 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4Q12950 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4Q12950 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4Q12950 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4Q12950 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4Q12950 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4Q12950 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4Q12950 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXD4Q12950 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
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