Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXC1Q12948 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXC1Q12948 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXC1Q12948 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXC1Q12948 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXC1Q12948 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXC1Q12948 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXC1Q12948 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXC1Q12948 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXC1Q12948 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXC1Q12948 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXC1Q12948 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXC1Q12948 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXC1Q12948 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXC1Q12948 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXC1Q12948 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXC1Q12948 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXC1Q12948 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXC1Q12948 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXC1Q12948 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXC1Q12948 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXC1Q12948 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXC1Q12948 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXC1Q12948 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXC1Q12948 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXC1Q12948 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXC1Q12948 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXC1Q12948 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXC1Q12948 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXC1Q12948 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXC1Q12948 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXC1Q12948 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXC1Q12948 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXC1Q12948 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXC1Q12948 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXC1Q12948 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXC1Q12948 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXC1Q12948 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXC1Q12948 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXC1Q12948 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXC1Q12948 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXC1Q12948 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXC1Q12948 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXC1Q12948 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXC1Q12948 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXC1Q12948 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXC1Q12948 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXC1Q12948 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FOXC1Q12948 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FOXC1Q12948 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FOXC1Q12948 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXC1Q12948 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXC1Q12948 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXC1Q12948 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXC1Q12948 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXC1Q12948 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXC1Q12948 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXC1Q12948 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXC1Q12948 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXC1Q12948 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXC1Q12948 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXC1Q12948 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXC1Q12948 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXC1Q12948 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXC1Q12948 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXC1Q12948 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXC1Q12948 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXC1Q12948 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXC1Q12948 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXC1Q12948 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXC1Q12948 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXC1Q12948 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXC1Q12948 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXC1Q12948 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXC1Q12948 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXC1Q12948 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXC1Q12948 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FOXC1Q12948 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FOXC1Q12948 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXC1Q12948 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXC1Q12948 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXC1Q12948 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXC1Q12948 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXC1Q12948 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXC1Q12948 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXC1Q12948 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXC1Q12948 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXC1Q12948 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXC1Q12948 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXC1Q12948 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXC1Q12948 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXC1Q12948 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXC1Q12948 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXC1Q12948 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXC1Q12948 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXC1Q12948 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXC1Q12948 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXC1Q12948 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXC1Q12948 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXC1Q12948 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms