Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXF2Q12947 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXF2Q12947 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXF2Q12947 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXF2Q12947 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXF2Q12947 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXF2Q12947 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXF2Q12947 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXF2Q12947 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXF2Q12947 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
FOXF2Q12947 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FOXF2Q12947 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXF2Q12947 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXF2Q12947 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXF2Q12947 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXF2Q12947 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXF2Q12947 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXF2Q12947 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXF2Q12947 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXF2Q12947 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXF2Q12947 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXF2Q12947 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXF2Q12947 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXF2Q12947 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXF2Q12947 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXF2Q12947 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXF2Q12947 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXF2Q12947 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXF2Q12947 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXF2Q12947 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FOXF2Q12947 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXF2Q12947 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXF2Q12947 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXF2Q12947 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXF2Q12947 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FOXF2Q12947 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FOXF2Q12947 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXF2Q12947 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXF2Q12947 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXF2Q12947 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXF2Q12947 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXF2Q12947 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXF2Q12947 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXF2Q12947 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXF2Q12947 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXF2Q12947 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXF2Q12947 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXF2Q12947 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXF2Q12947 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXF2Q12947 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXF2Q12947 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXF2Q12947 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXF2Q12947 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXF2Q12947 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXF2Q12947 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXF2Q12947 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXF2Q12947 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXF2Q12947 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXF2Q12947 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXF2Q12947 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXF2Q12947 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXF2Q12947 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXF2Q12947 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXF2Q12947 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXF2Q12947 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXF2Q12947 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXF2Q12947 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXF2Q12947 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXF2Q12947 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXF2Q12947 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXF2Q12947 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXF2Q12947 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXF2Q12947 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXF2Q12947 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXF2Q12947 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXF2Q12947 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXF2Q12947 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXF2Q12947 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXF2Q12947 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXF2Q12947 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXF2Q12947 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXF2Q12947 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXF2Q12947 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXF2Q12947 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXF2Q12947 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXF2Q12947 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXF2Q12947 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXF2Q12947 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXF2Q12947 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXF2Q12947 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXF2Q12947 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXF2Q12947 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXF2Q12947 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXF2Q12947 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXF2Q12947 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXF2Q12947 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXF2Q12947 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXF2Q12947 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXF2Q12947 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXF2Q12947 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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