Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
DDR1Q08345 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
DDR1Q08345 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
DDR1Q08345 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
DDR1Q08345 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
DDR1Q08345 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
DDR1Q08345 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
DDR1Q08345 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
DDR1Q08345 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
DDR1Q08345 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
DDR1Q08345 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
DDR1Q08345 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
DDR1Q08345 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
DDR1Q08345 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
DDR1Q08345 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
DDR1Q08345 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
DDR1Q08345 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
DDR1Q08345 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
DDR1Q08345 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
DDR1Q08345 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
DDR1Q08345 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
DDR1Q08345 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
DDR1Q08345 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
DDR1Q08345 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC30.44■■■□□ 2.46
DDR1Q08345 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
DDR1Q08345 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
DDR1Q08345 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
DDR1Q08345 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
DDR1Q08345 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
DDR1Q08345 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
DDR1Q08345 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
DDR1Q08345 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC30.42■■■□□ 2.46
DDR1Q08345 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
DDR1Q08345 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
DDR1Q08345 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
DDR1Q08345 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
DDR1Q08345 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
DDR1Q08345 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
DDR1Q08345 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
DDR1Q08345 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
DDR1Q08345 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
DDR1Q08345 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC30.4■■■□□ 2.46
DDR1Q08345 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
DDR1Q08345 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
DDR1Q08345 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
DDR1Q08345 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
DDR1Q08345 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
DDR1Q08345 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
DDR1Q08345 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
DDR1Q08345 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
DDR1Q08345 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
DDR1Q08345 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
DDR1Q08345 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
DDR1Q08345 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
DDR1Q08345 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
DDR1Q08345 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
DDR1Q08345 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
DDR1Q08345 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
DDR1Q08345 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
DDR1Q08345 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
DDR1Q08345 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
DDR1Q08345 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
DDR1Q08345 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
DDR1Q08345 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
DDR1Q08345 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
DDR1Q08345 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
DDR1Q08345 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
DDR1Q08345 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
DDR1Q08345 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
DDR1Q08345 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
DDR1Q08345 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
DDR1Q08345 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
DDR1Q08345 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
DDR1Q08345 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
DDR1Q08345 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
DDR1Q08345 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
DDR1Q08345 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
DDR1Q08345 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
DDR1Q08345 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC30.32■■■□□ 2.44
DDR1Q08345 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
DDR1Q08345 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
DDR1Q08345 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
DDR1Q08345 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
DDR1Q08345 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
DDR1Q08345 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC30.31■■■□□ 2.44
DDR1Q08345 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
DDR1Q08345 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
DDR1Q08345 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
DDR1Q08345 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
DDR1Q08345 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
DDR1Q08345 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
DDR1Q08345 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
DDR1Q08345 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
DDR1Q08345 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
DDR1Q08345 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
DDR1Q08345 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
DDR1Q08345 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
DDR1Q08345 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
DDR1Q08345 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
DDR1Q08345 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms