Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CKAP4Q07065 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CKAP4Q07065 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CKAP4Q07065 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CKAP4Q07065 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CKAP4Q07065 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CKAP4Q07065 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CKAP4Q07065 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CKAP4Q07065 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CKAP4Q07065 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CKAP4Q07065 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CKAP4Q07065 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CKAP4Q07065 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CKAP4Q07065 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CKAP4Q07065 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CKAP4Q07065 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CKAP4Q07065 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CKAP4Q07065 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CKAP4Q07065 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CKAP4Q07065 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CKAP4Q07065 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CKAP4Q07065 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CKAP4Q07065 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CKAP4Q07065 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CKAP4Q07065 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CKAP4Q07065 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CKAP4Q07065 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CKAP4Q07065 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CKAP4Q07065 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CKAP4Q07065 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CKAP4Q07065 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CKAP4Q07065 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CKAP4Q07065 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CKAP4Q07065 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CKAP4Q07065 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CKAP4Q07065 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CKAP4Q07065 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CKAP4Q07065 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CKAP4Q07065 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CKAP4Q07065 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CKAP4Q07065 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CKAP4Q07065 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CKAP4Q07065 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CKAP4Q07065 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CKAP4Q07065 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CKAP4Q07065 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CKAP4Q07065 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CKAP4Q07065 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CKAP4Q07065 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CKAP4Q07065 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CKAP4Q07065 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CKAP4Q07065 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CKAP4Q07065 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CKAP4Q07065 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CKAP4Q07065 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CKAP4Q07065 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CKAP4Q07065 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CKAP4Q07065 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CKAP4Q07065 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CKAP4Q07065 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CKAP4Q07065 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CKAP4Q07065 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CKAP4Q07065 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CKAP4Q07065 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CKAP4Q07065 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CKAP4Q07065 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CKAP4Q07065 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CKAP4Q07065 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CKAP4Q07065 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CKAP4Q07065 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CKAP4Q07065 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CKAP4Q07065 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CKAP4Q07065 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CKAP4Q07065 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CKAP4Q07065 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CKAP4Q07065 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CKAP4Q07065 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CKAP4Q07065 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CKAP4Q07065 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CKAP4Q07065 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CKAP4Q07065 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CKAP4Q07065 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CKAP4Q07065 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CKAP4Q07065 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CKAP4Q07065 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CKAP4Q07065 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CKAP4Q07065 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CKAP4Q07065 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CKAP4Q07065 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CKAP4Q07065 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CKAP4Q07065 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CKAP4Q07065 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CKAP4Q07065 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CKAP4Q07065 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CKAP4Q07065 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CKAP4Q07065 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CKAP4Q07065 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CKAP4Q07065 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CKAP4Q07065 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CKAP4Q07065 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms