Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDSRQ06136 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDSRQ06136 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDSRQ06136 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDSRQ06136 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDSRQ06136 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDSRQ06136 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDSRQ06136 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDSRQ06136 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDSRQ06136 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDSRQ06136 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDSRQ06136 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDSRQ06136 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDSRQ06136 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDSRQ06136 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDSRQ06136 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDSRQ06136 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDSRQ06136 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDSRQ06136 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDSRQ06136 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDSRQ06136 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDSRQ06136 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDSRQ06136 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDSRQ06136 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDSRQ06136 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDSRQ06136 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDSRQ06136 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDSRQ06136 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDSRQ06136 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDSRQ06136 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDSRQ06136 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDSRQ06136 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDSRQ06136 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDSRQ06136 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KDSRQ06136 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KDSRQ06136 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KDSRQ06136 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KDSRQ06136 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KDSRQ06136 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KDSRQ06136 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
KDSRQ06136 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KDSRQ06136 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KDSRQ06136 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KDSRQ06136 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDSRQ06136 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDSRQ06136 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDSRQ06136 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDSRQ06136 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDSRQ06136 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDSRQ06136 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDSRQ06136 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDSRQ06136 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDSRQ06136 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDSRQ06136 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KDSRQ06136 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDSRQ06136 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDSRQ06136 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDSRQ06136 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDSRQ06136 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDSRQ06136 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDSRQ06136 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDSRQ06136 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDSRQ06136 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDSRQ06136 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDSRQ06136 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDSRQ06136 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDSRQ06136 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDSRQ06136 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDSRQ06136 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDSRQ06136 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDSRQ06136 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDSRQ06136 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDSRQ06136 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDSRQ06136 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDSRQ06136 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms