Protein–RNA interactions for Protein: Q05932

FPGS, Folylpolyglutamate synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FPGSQ05932 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FPGSQ05932 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FPGSQ05932 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FPGSQ05932 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FPGSQ05932 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
FPGSQ05932 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FPGSQ05932 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FPGSQ05932 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FPGSQ05932 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FPGSQ05932 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FPGSQ05932 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FPGSQ05932 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FPGSQ05932 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FPGSQ05932 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FPGSQ05932 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FPGSQ05932 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FPGSQ05932 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FPGSQ05932 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FPGSQ05932 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FPGSQ05932 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FPGSQ05932 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
FPGSQ05932 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FPGSQ05932 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FPGSQ05932 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FPGSQ05932 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FPGSQ05932 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FPGSQ05932 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FPGSQ05932 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FPGSQ05932 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FPGSQ05932 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FPGSQ05932 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FPGSQ05932 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
FPGSQ05932 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FPGSQ05932 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FPGSQ05932 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FPGSQ05932 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FPGSQ05932 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
FPGSQ05932 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FPGSQ05932 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FPGSQ05932 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FPGSQ05932 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FPGSQ05932 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FPGSQ05932 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FPGSQ05932 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FPGSQ05932 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FPGSQ05932 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FPGSQ05932 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FPGSQ05932 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FPGSQ05932 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FPGSQ05932 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FPGSQ05932 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FPGSQ05932 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FPGSQ05932 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FPGSQ05932 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FPGSQ05932 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FPGSQ05932 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FPGSQ05932 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FPGSQ05932 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
FPGSQ05932 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FPGSQ05932 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FPGSQ05932 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FPGSQ05932 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FPGSQ05932 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FPGSQ05932 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FPGSQ05932 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FPGSQ05932 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FPGSQ05932 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FPGSQ05932 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FPGSQ05932 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
FPGSQ05932 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FPGSQ05932 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FPGSQ05932 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
FPGSQ05932 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FPGSQ05932 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FPGSQ05932 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FPGSQ05932 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FPGSQ05932 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FPGSQ05932 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
FPGSQ05932 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FPGSQ05932 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FPGSQ05932 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FPGSQ05932 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FPGSQ05932 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FPGSQ05932 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FPGSQ05932 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FPGSQ05932 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FPGSQ05932 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FPGSQ05932 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FPGSQ05932 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FPGSQ05932 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FPGSQ05932 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FPGSQ05932 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FPGSQ05932 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FPGSQ05932 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FPGSQ05932 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FPGSQ05932 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FPGSQ05932 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FPGSQ05932 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FPGSQ05932 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
FPGSQ05932 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms