Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD164Q04900 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD164Q04900 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CD164Q04900 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD164Q04900 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CD164Q04900 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD164Q04900 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD164Q04900 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD164Q04900 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD164Q04900 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD164Q04900 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD164Q04900 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD164Q04900 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CD164Q04900 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD164Q04900 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD164Q04900 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CD164Q04900 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CD164Q04900 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD164Q04900 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CD164Q04900 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD164Q04900 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD164Q04900 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD164Q04900 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD164Q04900 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD164Q04900 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CD164Q04900 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CD164Q04900 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD164Q04900 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD164Q04900 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD164Q04900 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD164Q04900 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD164Q04900 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CD164Q04900 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD164Q04900 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD164Q04900 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD164Q04900 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD164Q04900 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD164Q04900 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CD164Q04900 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD164Q04900 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD164Q04900 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD164Q04900 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD164Q04900 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD164Q04900 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD164Q04900 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD164Q04900 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD164Q04900 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD164Q04900 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD164Q04900 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD164Q04900 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CD164Q04900 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CD164Q04900 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CD164Q04900 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CD164Q04900 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CD164Q04900 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CD164Q04900 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CD164Q04900 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CD164Q04900 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CD164Q04900 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CD164Q04900 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CD164Q04900 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CD164Q04900 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD164Q04900 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD164Q04900 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD164Q04900 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD164Q04900 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD164Q04900 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD164Q04900 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD164Q04900 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CD164Q04900 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CD164Q04900 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD164Q04900 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD164Q04900 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD164Q04900 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD164Q04900 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD164Q04900 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD164Q04900 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD164Q04900 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD164Q04900 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD164Q04900 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD164Q04900 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD164Q04900 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD164Q04900 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CD164Q04900 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CD164Q04900 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CD164Q04900 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CD164Q04900 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CD164Q04900 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CD164Q04900 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD164Q04900 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD164Q04900 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CD164Q04900 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD164Q04900 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD164Q04900 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD164Q04900 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD164Q04900 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD164Q04900 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD164Q04900 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD164Q04900 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD164Q04900 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms