Protein–RNA interactions for Protein: Q04695

KRT17, Keratin, type I cytoskeletal 17, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17Q04695 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT17Q04695 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT17Q04695 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT17Q04695 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT17Q04695 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT17Q04695 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT17Q04695 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT17Q04695 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT17Q04695 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
KRT17Q04695 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
KRT17Q04695 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT17Q04695 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT17Q04695 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT17Q04695 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT17Q04695 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT17Q04695 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT17Q04695 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT17Q04695 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT17Q04695 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT17Q04695 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT17Q04695 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT17Q04695 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT17Q04695 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT17Q04695 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT17Q04695 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT17Q04695 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT17Q04695 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT17Q04695 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT17Q04695 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT17Q04695 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT17Q04695 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT17Q04695 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT17Q04695 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT17Q04695 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT17Q04695 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT17Q04695 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT17Q04695 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT17Q04695 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT17Q04695 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT17Q04695 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT17Q04695 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT17Q04695 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT17Q04695 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT17Q04695 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT17Q04695 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT17Q04695 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT17Q04695 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT17Q04695 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT17Q04695 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KRT17Q04695 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT17Q04695 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT17Q04695 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT17Q04695 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT17Q04695 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT17Q04695 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT17Q04695 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT17Q04695 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT17Q04695 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT17Q04695 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT17Q04695 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT17Q04695 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT17Q04695 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT17Q04695 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT17Q04695 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT17Q04695 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT17Q04695 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT17Q04695 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT17Q04695 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT17Q04695 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT17Q04695 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT17Q04695 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT17Q04695 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT17Q04695 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT17Q04695 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT17Q04695 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT17Q04695 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT17Q04695 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT17Q04695 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT17Q04695 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT17Q04695 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT17Q04695 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT17Q04695 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT17Q04695 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT17Q04695 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT17Q04695 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT17Q04695 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT17Q04695 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT17Q04695 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT17Q04695 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT17Q04695 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT17Q04695 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT17Q04695 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT17Q04695 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT17Q04695 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT17Q04695 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT17Q04695 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT17Q04695 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT17Q04695 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT17Q04695 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT17Q04695 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms